RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	HLR1	Q04429	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	HIM1	Q06674	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	TPO1	Q07824	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MSM1	P22438	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	OMA1	P36163	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	APN2	P38207	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	PZF1	P39933	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	PFA3	P42836	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	IES1	P43579	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	IRC5	P43610	853 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	TEP1	P53916	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ADY3	Q07732	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	UPC2	Q12151	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SED4	P25365	1065 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	DGR2	P32330	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	STE14	P32584	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	DUN1	P39009	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	STL1	P39932	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ERR3	P42222	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	TAF1	P46677	1066 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ASI2	P53895	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ORC3	P54790	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YPS7	Q06325	596 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	PSF3	Q12146	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ARP7	Q12406	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	CYC7	P00045	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MSH1	P25846	959 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	RPN12	P32496	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SDS22	P36047	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	GID8	P40208	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	IML2	P47031	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	CIA1	Q05583	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ENT2	Q05785	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SSP2	Q08646	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
PRX1	YBL064C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	TGL1	P34163	548 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	YEL076C	P39971	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	VHR1	P40522	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	MET12	P46151	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	INP52	P50942	1183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	EXG2	P52911	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	YBP2	P53169	641 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	GTR1	Q00582	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	STP4	Q07351	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	YLR415C	O13578	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	PET127	P32606	800 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	APM3	P38153	483 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	UBA2	P52488	636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	PLB2	Q03674	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	BLS1	Q06071	122 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SGD1	Q06132	899 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	HIS5	P07172	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ADH4	P10127	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	NGG1	P32494	702 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	BEM3	P32873	1128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	LRG1	P35688	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SIC1	P38634	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	MSS4	P38994	779 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SPC72	P39723	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	MAD3	P47074	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	AVT1	P47082	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	GCV2	P49095	1034 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	PKH1	Q03407	766 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	ROT1	Q03691	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	VHS3	Q08438	674 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRX1	YBL064C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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