RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	MET7	Q08645	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	SET3	P36124	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	YMC2	P38087	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	NUP60	P39705	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	HXT16	P47185	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	YGR125W	P53273	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	KCC4	P25389	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	GCS1	P35197	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	PXL1	P36166	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	YHR112C	P38716	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	MIT1	P40002	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ULA1	Q12059	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	BET3	P36149	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	TIM54	P47045	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	PHO5	P00635	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ALY2	P47029	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	PER1	P25625	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	TY4A-J	P47023	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	SPC98	P53540	846 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	YDR338C	Q05497	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	FLC1	Q08967	793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	APT2	P36973	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ORC4	P54791	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	MCM21	Q06675	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	EUG1	P32474	517 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ZRT2	Q12436	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	Q0140	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	RTA1	P53047	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	CAN1	P04817	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	BNA2	P47125	453 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	SCW10	Q04951	389 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	ORM2	Q06144	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	FRE7	Q12333	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	GET2	P40056	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	YFL052W	P43551	465 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	NDD1	Q08887	554 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	YJL049W	P47048	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	PIP2	P52960	996 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	REC102	Q02721	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VAR1	Q0140	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	PEX1	P24004	1043 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	MET30	P39014	640 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	HUL5	P53119	910 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	YGR151C	P53287	111 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	MTC2	P34246	357 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	GAL11	P19659	1081 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	MCD4	P36051	919 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	SLX1	P38324	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	NPY1	P53164	384 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	ABF1	P14164	731 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	BEM3	P32873	1128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	ASK1	P35734	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	GID8	P40208	455 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	YOR111W	Q99210	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	NUP53	Q03790	475 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	BCS1	P32839	456 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	YAT2	P40017	923 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	PCI8	P40512	444 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VAR1	Q0140	PRP28	P23394	588 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	BIT2	P38346	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	GDH3	P39708	457 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	PIG2	P40187	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	COX18	P53239	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	THI22	Q06490	572 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	SPC97	P38863	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	ARG7	Q04728	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YDL086W	Q07505	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	ECM3	Q99252	613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	TPK2	P06245	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YKR051W	P36142	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	CAF16	P43569	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.9 ms