RNA–Protein interactions for RNA: YOR295W

UAF30, Transcript of Subunit of UAF (upstream activation factor) complex, yeast

Gene UAF30, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UAF30	YOR295W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	ALY2	P47029	1046 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	AIM14	P53109	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	ERG5	P54781	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	SLX4	Q12098	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	ATP4	P05626	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	HSL7	P38274	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	CHS7	P38843	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	MSE1	P48525	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	TGL2	P54857	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PLC1	P32383	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	DID4	P36108	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	YHR078W	P38799	552 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	AIM21	P40563	679 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	NIT2	P47016	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PEX14	P53112	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	SND1	Q04007	877 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	THI21	Q08975	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	TRM13	Q12383	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	DIF1	O13577	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	AEP2	P22136	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PEA2	P40091	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	RET2	P43621	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	BNA2	P47125	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PUS2	P53167	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	MRPS35	P53292	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	ECM9	Q02202	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PEX19	Q07418	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UAF30	YOR295W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	CTF13	P35203	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YKR018C	P36114	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	HXT7	P39004	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SHR5	P41912	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	DAS1	P47005	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	ZIP2	P53061	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	NPY1	P53164	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	ASI2	P53895	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YNL034W	P53963	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YNL018C	P53976	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	AIM39	Q08223	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	GPR1	Q12361	961 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	APM4	Q99186	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PRC1	P00729	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	HIR1	P32479	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	TFC4	P33339	1025 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SAP190	P36123	1033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	TDA3	P38758	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	VHR1	P40522	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YGR153W	P48238	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	ASM4	Q05166	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	HFI1	Q12060	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SWM1	Q12379	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PNS1	Q12412	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RMP1	Q12530	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YKR051W	P36142	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	BIT2	P38346	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	EMP65	P40085	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SSY5	P47002	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SKY1	Q03656	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	TRM11	Q12463	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	MPD2	Q99316	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	ERG4	P25340	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	DAL3	P32459	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	MNN4	P36044	1178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	MAL31	P38156	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YFL052W	P43551	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	CRR1	Q05790	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	DCS2	Q12123	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PIF1	P07271	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SWE1	P32944	819 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SAK1	P38990	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	FKH2	P41813	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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