RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	ALG1	P16661	449 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	MRC1	P25588	1096 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SPC110	P32380	944 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PFF1	P38244	976 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	TCD1	P38756	429 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PRK1	P40494	810 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	AVT1	P47082	602 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YJR124C	P47159	448 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YJR142W	P47173	342 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PEX13	P80667	386 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ROD1	Q02805	837 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ERO1	Q03103	563 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	VPS60	Q03390	229 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UBX5	Q06682	500 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ATG9	Q12142	997 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CEX1	Q12453	761 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	MRP10	O75012	95 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	GAL11	P19659	1081 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	HIR1	P32479	840 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	MKK2	P32491	506 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RPC25	P35718	212 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SAP190	P36123	1033 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	NEM1	P38757	446 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	VPS8	P39702	1274 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UBX2	Q04228	584 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SPO20	Q04359	397 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	VPS38	Q05919	439 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SPO75	Q07798	868 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	TLG2	Q08144	397 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	TIP41	Q12199	356 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	HKR1	P41809	1802 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	FLO11	P08640	1367 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CAN1	P04817	590 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.35	□□□□□ -1.55	not detected
TRS33	YOR115C	PET111	P08468	800 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SAC7	P17121	654 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.35	□□□□□ -1.55	not detected
TRS33	YOR115C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	BCD1	P38772	366 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CTM1	P38818	585 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CCC2	P38995	1004 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YGR153W	P48238	217 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UBA2	P52488	636 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RTA1	P53047	317 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YNR065C	P53751	1116 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RTC4	P53850	401 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	MDM1	Q01846	1127 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RKM2	Q03942	479 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ADY4	Q05955	493 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	DSE3	Q08729	430 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YIG1	Q08956	461 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PSF3	Q12146	194 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SPO12	P17123	173 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CHS3	P29465	1165 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	PET10	P36139	283 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CAJ1	P39101	391 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	FET4	P40988	552 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CIT3	P43635	486 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	ASE1	P50275	885 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	HFM1	P51979	1187 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	GUP1	P53154	560 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YGR125W	P53273	1036 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YAP7	Q08182	245 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	HMI1	Q12039	706 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	RKM4	Q12504	494 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRS33	YOR115C	NUC1	P08466	329 aa		5.33	□□□□□ -1.56

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