RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MGM1	P32266	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ALG14	P38242	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RTT107	P38850	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SAK1	P38990	1142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MBP1	P39678	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ICP55	P40051	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ZIM17	P42844	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YJL181W	P46987	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ALT1	P52893	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	LSB1	P53281	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RET3	P53600	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YNR014W	P53719	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NSG2	P53898	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	GIS4	Q04233	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TRM8	Q12009	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NUP145	P49687	1317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	FUS1	P11710	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MRPS28	P21771	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	DPH2	P32461	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MMM1	P41800	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	XKS1	P42826	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MDV1	P47025	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ASI1	P54074	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BSC2	Q05611	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	OPY2	Q06810	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ADY3	Q07732	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NYV1	Q12255	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MPD2	Q99316	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	JIP3	O13555	125 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ATP4	P05626	244 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	HIS3	P06633	220 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RPC53	P25441	422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MSH2	P25847	964 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MEI4	P29467	408 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	DOM34	P33309	386 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TFC4	P33339	1025 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YKL063C	P35725	167 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
MSE1	YOL033W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	HUL4	P40985	892 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	EPL1	P43572	832 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	POL32	P47110	350 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NSE5	Q03718	556 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YKU80	Q04437	629 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SML1	Q04964	104 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SRB4	P32569	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RPC34	P32910	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PPQ1	P32945	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HSP78	P33416	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VPS51	P36116	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	STV1	P37296	890 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	IFA38	P38286	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PEX32	P38292	413 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YBR242W	P38331	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	INA22	P40576	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	STU2	P46675	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	BNA1	P47096	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GUP1	P53154	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YNL193W	P53870	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
MSE1	YOL033W	TAF8	Q03750	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ARP9	Q05123	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TDA6	Q06466	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SOG2	Q08817	791 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SSN2	P38931	1420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ARG81	P05085	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	CTT1	P06115	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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