RNA–Protein interactions for RNA: YOL008W

COQ10, Transcript of Coenzyme Q (ubiquinone) binding protein, yeast

Gene COQ10, Length 624 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COQ10	YOL008W	RIM13	Q03792	727 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	EAF1	Q06337	982 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	UBX5	Q06682	500 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	THI21	Q08975	551 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	EMC3	P36039	253 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	PAC2	P39937	518 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SEG1	Q04279	960 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SPO75	Q07798	868 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	GPR1	Q12361	961 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SWE1	P32944	819 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SPC29	P33419	253 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	UBS1	P38290	277 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SFB3	P38810	929 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SCS3	P53012	380 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	ERP6	P53198	216 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	PTP1	P25044	335 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ARE1	P25628	610 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	SHR5	P41912	237 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ATG36	P46983	293 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	NNF1	P47149	201 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YBP2	P53169	641 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	REH1	Q06709	432 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ECM1	P39715	212 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	GYP8	P43570	497 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ZIP2	P53061	704 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	MTL1	P53214	551 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ATG4	P53867	494 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	VPS72	Q03388	795 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	OSW1	Q08692	278 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	FMO1	P38866	432 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	MRK1	P50873	501 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	PHO11	P35842	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	PHO12	P38693	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	NUP60	P39705	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	OSH2	Q12451	1283 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	DIF1	O13577	133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ERG11	P10614	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	NET1	P47035	1189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	FHN1	P53279	174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YHR112C	P38716	378 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	MUP3	P38734	546 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
COQ10	YOL008W	LYS9	P38999	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	LTP1	P40347	161 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	OSW7	P43611	510 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	RNH70	P53331	553 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	MLH3	Q12083	715 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	RGT2	Q12300	763 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	YUR1	P26725	428 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	PPG1	P32838	368 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	XBP1	P40489	647 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	MET7	Q08645	548 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COQ10	YOL008W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	FUB1	P25659	250 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	TOM20	P35180	183 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	GMH1	P36125	273 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	APT2	P36973	181 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	ALG2	P43636	503 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	USV1	Q12132	391 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.33	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.32	□□□□□ -1.88	not detected
COQ10	YOL008W	NUP1	P20676	1076 aa		3.32	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	TSR4	P25040	408 aa		3.32	□□□□□ -1.88
COQ10	YOL008W	KCC4	P25389	1037 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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