RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	GAD1	Q04792	585 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MGR3	YMR115W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MGR3	YMR115W	FMP52	P40008	231 aa		5.84	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	CAF16	P43569	289 aa		5.84	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	BNA2	P47125	453 aa		5.84	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	UBC11	P52492	156 aa		5.84	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	YFL052W	P43551	465 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	SGO1	Q08490	590 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	PHO8	P11491	566 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MEF1	P25039	761 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	GSY1	P23337	708 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	DSS1	P39112	969 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	NPY1	P53164	384 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	ORC4	P54791	529 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
MGR3	YMR115W	VBA3	P25594	458 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	TEL2	P53038	688 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MSH2	P25847	964 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	HIR1	P32479	840 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	YHR112C	P38716	378 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MIH1	P23748	554 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	MTL1	P53214	551 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	SSL2	Q00578	843 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	CIT2	P08679	460 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	YKR051W	P36142	418 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	LYS9	P38999	446 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MGR3	YMR115W	SIR3	P06701	978 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	SRD1	P09007	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	THI4	P32318	326 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	BRN1	P38170	754 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	REV7	P38927	245 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	YML122C	Q03207	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	NHX1	Q04121	633 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	MCM21	Q06675	368 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	SUT2	Q12286	268 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	CDC43	P18898	376 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	HOG1	P32485	435 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	PEX6	P33760	1030 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	HSL7	P38274	827 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	FMO1	P38866	432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	YAP1802	P53309	568 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	UGO1	Q03327	502 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	KIN3	P22209	435 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	APT2	P36973	181 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	TDP1	P38319	544 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	NUP60	P39705	539 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	ATF1	P40353	525 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	RAD18	P10862	487 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	YKR018C	P36114	725 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	SFB3	P38810	929 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	PCL10	P53124	433 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	PPG1	P32838	368 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	OSW7	P43611	510 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	TAH11	P47112	604 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
MGR3	YMR115W	GID8	P40208	455 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	RNH70	P53331	553 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	ARP4	P80428	489 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	REC102	Q02721	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MGR3	YMR115W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	NDC80	P40460	691 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	IOC4	Q04213	475 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	PCL2	P25693	308 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	YJL206C	P39529	758 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	GET2	P40056	285 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MGR3	YMR115W	ATG33	Q06485	197 aa		5.7	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 131.7 ms