RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SMC1	P32908	1225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PEX32	P38292	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YBR225W	P38321	900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	RTS1	P38903	757 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	EMP65	P40085	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PXA1	P41909	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ENT3	P47160	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	AIM14	P53109	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YNR068C	P53754	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HDA3	Q06623	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SKS1	Q12505	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	CDC9	P04819	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PRE3	P38624	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	INA22	P40576	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ZIP2	P53061	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SFI1	Q12369	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	FRE6	Q12473	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	CDC16	P09798	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YKU70	P32807	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SPT23	P35210	1082 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PCH2	P38126	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	NPR2	P39923	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HXT13	P39924	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	EPL1	P43572	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HXT17	P53631	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HXT15	P54854	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	CIK1	Q01649	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PEX15	Q08215	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	MLS1	P30952	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	KRE6	P32486	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	XRS2	P33301	854 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SAP190	P36123	1033 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	AXL2	P38928	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PKP1	P40530	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	MFB1	Q04922	465 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HMI1	Q12039	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	BMT6	Q12291	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	FLP1	P03870	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YER152C	P10356	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TRK1	P12685	1235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	GPI10	P30777	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	DEP1	P31385	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SPC110	P32380	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SMI1	P32566	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	BUD2	P33314	1104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	MCD4	P36051	919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	DUN1	P39009	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SLD3	P53135	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TBF1	Q02457	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YML119W	Q03208	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	RMT2	Q03305	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TFC6	Q06339	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
STB2	YMR053C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	RAD18	P10862	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	MRPL33	P20084	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	STE50	P25344	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	IRE1	P32361	1115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	CCZ1	P38273	704 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	STL1	P39932	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	NEO1	P40527	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	XKS1	P42826	600 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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