RNA–Protein interactions for RNA: YML077W

BET5, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene BET5, Length 480 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BET5	YML077W	ADY3	Q07732	790 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	TPO1	Q07824	586 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	APM4	Q99186	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	GAL1	P04385	528 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	ATP12	P22135	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	STE14	P32584	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	MAL31	P38156	614 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PIP2	P52960	996 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SKY1	Q03656	742 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	ROT1	Q03691	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	UPC2	Q12151	913 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	KAR1	P11927	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SEC65	P29478	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	NIC96	P34077	839 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YHR078W	P38799	552 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	IES5	P40060	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	CDC6	P09119	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SWI6	P09959	803 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	KCC4	P25389	1037 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	THI80	P35202	319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SAK1	P38990	1142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	BEM4	P39011	633 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PFA3	P42836	336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SPC105	P53148	917 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	MSS4	P38994	779 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	UBX4	P54730	416 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PEX15	Q08215	383 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	HMI1	Q12039	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
BET5	YML077W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	CDC26	P14724	124 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	PTP2	P29461	750 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YKU70	P32807	602 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YHR202W	P38887	602 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	MET12	P46151	657 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SLD3	P53135	668 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	ASI2	P53895	289 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	ATG16	Q03818	150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	SGD1	Q06132	899 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET5	YML077W	HIS5	P07172	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	EMC1	P25574	760 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	ATG19	P35193	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	KTR4	P38131	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	LAM1	P38851	1228 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	VHR1	P40522	640 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	VID28	P40547	921 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	NCS6	P53088	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	VPS62	P53285	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	DUS4	Q06063	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	YPS7	Q06325	596 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	MLC2	Q06580	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	OMS1	Q06668	471 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	SED4	P25365	1065 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	HXT4	P32467	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	MEF2	P39677	819 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	EAF5	P39995	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	EMP65	P40085	556 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	CHA4	P43634	648 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	YGR021W	P53212	290 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET5	YML077W	YAP6	Q03935	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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