RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	ERO1	Q03103	563 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TAH18	Q12181	623 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NNK1	P36003	928 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	DCS2	Q12123	353 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SFI1	Q12369	946 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TRK1	P12685	1235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	AAC3	P18238	307 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	ATP12	P22135	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	LAM1	P38851	1228 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SAP4	P53036	818 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MRPL19	P53875	158 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SRT1	Q03175	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	DPH6	Q12429	685 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TGL1	P34163	548 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NPR3	P38742	1146 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YAP1802	P53309	568 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TNA1	P53322	534 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NSE5	Q03718	556 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YKU80	Q04437	629 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	VID22	Q05934	901 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	BMT6	Q12291	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SPT7	P35177	1332 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	UBS1	P38290	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	IRC5	P43610	853 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YKR051W	P36142	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	VHR1	P40522	640 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MTC3	P53077	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TFC6	Q06339	672 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CBF2	P32504	956 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YLF2	P38746	405 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YFL052W	P43551	465 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CTF18	P49956	741 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	ELG1	Q12050	791 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NUC1	P08466	329 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MET8	P15807	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	GPB2	P39717	880 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SHR5	P41912	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	PCL10	P53124	433 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CDC16	P09798	840 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SPO16	P17122	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SNF5	P18480	905 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	DIT1	P21623	536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	AXL2	P38928	823 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	BEM4	P39011	633 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NPP2	P39997	493 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MAD3	P47074	515 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SWD1	P39706	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	FCP1	Q03254	732 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	PHO5	P00635	467 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SAC7	P17121	654 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
UBP12	YJL197W	FPS1	P23900	669 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MRPL36	P36531	177 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YHR202W	P38887	602 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YER010C	P40011	234 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	GIP2	P40036	548 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	PUG1	P40100	303 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CLA4	P48562	842 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	SRC1	Q03707	834 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	IRC3	Q06683	689 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	THI21	Q08975	551 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74

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