RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
YMR31	YFR049W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ZRG8	P40021	1076 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SSY5	P47002	699 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YGR012W	P53206	393 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	TEP1	P53916	434 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	OMS1	Q06668	471 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	THI72	Q08579	599 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	APM4	Q99186	491 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	INH1	P01097	85 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CMP2	P14747	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PHO3	P24031	467 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	DGR2	P32330	852 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	BEM3	P32873	1128 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YHR202W	P38887	602 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SAK1	P38990	1142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	DUN1	P39009	513 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PEX7	P39108	375 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	EAF5	P39995	279 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	VID28	P40547	921 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ORC4	P54791	529 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ARP4	P80428	489 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	GTR1	Q00582	310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YMR210W	Q03649	449 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	BLS1	Q06071	122 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
YMR31	YFR049W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SSP2	Q08646	371 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
YMR31	YFR049W	YDL176W	Q12027	708 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PHM7	Q12252	991 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SSM4	P40318	1319 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SWI6	P09959	803 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	HOP1	P20050	605 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MSM1	P22438	575 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MCM10	P32354	571 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SDS22	P36047	338 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PPE1	P38796	400 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PZF1	P39933	429 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MNT3	P40549	630 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MDM1	Q01846	1127 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MSC2	Q03455	724 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SSY1	Q03770	852 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	TDA6	Q06466	467 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CDA1	Q06702	301 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MCH5	Q08777	521 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ADP1	P25371	1049 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CHS3	P29465	1165 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	COQ2	P32378	372 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	HXT4	P32467	576 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PSY4	P38193	441 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	APN2	P38207	520 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YHR078W	P38799	552 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	STL1	P39932	569 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	TMA108	P40462	946 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YBP2	P53169	641 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ARP7	Q12406	477 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	KCS1	Q12494	1050 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	CHS2	P14180	963 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	TGL1	P34163	548 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	JNM1	P36224	373 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	TAT1	P38085	619 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	APM3	P38153	483 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	SAF1	P38352	637 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	BEM4	P39011	633 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YMR31	YFR049W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92

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