RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C NPP1P25353 742 aa3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C AGP1P25376 633 aa3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C FMP52P40008 231 aa3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YIR042CP40586 236 aa3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C DOP1Q03921 1698 aa3.23□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C AFR1P33304 620 aa3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C PAC2P39937 518 aa3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C TEL2P53038 688 aa3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C GDE1Q02979 1223 aa3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C VPS16Q03308 798 aa3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C PKH1Q03407 766 aa3.22□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YSP2Q06681 1438 aa3.21□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C PRP4P20053 465 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C RPD3P32561 433 aa3.21□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C DNF2Q12675 1612 aa3.21□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C SRB8P25648 1427 aa3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C ASF1P32447 279 aa3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C SIT1P39980 628 aa3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C HDA1P53973 706 aa3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C YKR011CQ02209 353 aa3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C ADE8P04161 214 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C YHR078WP38799 552 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C MEP2P41948 499 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C MRK1P50873 501 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C ASI2P53895 289 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C SHE9Q04172 456 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C TDA9Q04545 1251 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C IRC13Q08630 104 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C FAL1Q12099 399 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C SSM4P40318 1319 aa3.19□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C CLN2P20438 545 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C RFA1P22336 621 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C PPH3P32345 308 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C SCT1P32784 759 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C YKL069WP36088 180 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C GLG1P36143 616 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C VBA5P36172 582 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C YDR306CQ06640 478 aa3.18□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C STE4P18851 423 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C PRI2P20457 528 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C EMP70P32802 667 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C ERT1P38140 529 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C REV7P38927 245 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C BDH2P39713 417 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C NDC80P40460 691 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C XBP1P40489 647 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C VHR1P40522 640 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C CTR1P49573 406 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C ATG11Q12527 1178 aa3.17□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C MPH2P0CD99 609 aa3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C SPC29P33419 253 aa3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C GGA2P38817 585 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C ARG2P40360 574 aa3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C CWC24P53769 259 aa3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C OSW1Q08692 278 aa3.16□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C YOR093CQ12275 1648 aa3.15□□□□□ -1.9
GCN4YEL009C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C YRO2P38079 344 aa3.15□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PZF1P39933 429 aa3.15□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C CEP3P40969 608 aa3.15□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C NRG1Q03125 231 aa3.15□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C OPI10Q08202 246 aa3.15□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C ERG11P10614 530 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C YAP3P38749 330 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C BCD1P38772 366 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C MAD1P40957 749 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
GCN4YEL009C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C UBC11P52492 156 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C TPO2P53283 614 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C CIR2Q08822 631 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PIN2Q12057 282 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C DNF3Q12674 1656 aa3.13□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C YLR415CO13578 112 aa3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C MRP8P35719 219 aa3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
GCN4YEL009C TOK1P40310 691 aa3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C HOS4P40480 1083 aa3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C YPL068CQ02749 293 aa3.12□□□□□ -1.91
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