RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	CST9	Q06032	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ALR1	Q08269	859 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RDS1	P25611	832 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YME1	P32795	747 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	AFR1	P33304	620 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SPC42	P36094	363 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DYS1	P38791	387 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SMF1	P38925	575 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RPH1	P39956	796 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MDM1	Q01846	1127 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TFB3	Q03290	321 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RTT109	Q07794	436 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TIP41	Q12199	356 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SPO21	Q12411	609 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RED1	P14291	827 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	KIN3	P22209	435 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SET3	P36124	751 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MAL33	P38157	468 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ZRG8	P40021	1076 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	THI12	P42883	340 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	THI5	P43534	340 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YFL066C	P43538	392 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YJR039W	P47107	1121 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	THI11	P47183	340 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MEC3	Q02574	474 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MTC5	Q03897	1148 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	THI13	Q07748	340 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SMC5	Q08204	1093 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DCS2	Q12123	353 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YPL150W	Q12152	901 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PIF1	P07271	859 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SEC63	P14906	663 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	GSY1	P23337	708 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ADY2	P25613	283 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	POL4	P25615	582 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MAL31	P38156	614 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YBR225W	P38321	900 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RRF1	P38771	230 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
XRS2	YDR369C	GEM1	P39722	662 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	COG2	P53271	262 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DXO1	Q06349	442 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	GIC2	Q06648	383 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YDL121C	Q07541	149 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	GPI13	Q07830	1017 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SGO1	Q08490	590 aa		3.79	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	COQ4	O13525	335 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DBF2	P22204	572 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VPS3	P23643	1011 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CLB3	P24870	427 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	NTH2	P35172	780 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SDH8	P38345	138 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CCT6	P39079	546 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	BOI2	P39969	1040 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	JLP2	P40206	208 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PCI8	P40512	444 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	BRE2	P43132	505 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	STB4	P50104	949 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PEF1	P53238	335 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	COS6	P53344	381 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SPO1	P53541	631 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	BSC5	P53755	489 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ORC4	P54791	529 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	GTB1	Q04924	702 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VPS36	Q06696	566 aa		3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SPS1	P08458	490 aa		3.78	□□□□□ -1.8

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