RNA–Protein interactions for RNA: YDR349C

YPS7, Transcript of Putative GPI-anchored aspartic protease, yeast

Gene YPS7, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPS7	YDR349C	HMT1	P38074	348 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	CEM1	P39525	442 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	JJJ3	P47138	172 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	CTR1	P49573	406 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	LYS5	P50113	272 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	SPO1	P53541	631 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	CSI1	Q04368	295 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	GCS1	P35197	352 aa		5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	ISW1	P38144	1129 aa		5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	TPM2	P40414	161 aa		5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	ALT1	P52893	592 aa		5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	YOL098C	Q12496	1037 aa		5	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PTP1	P25044	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PGS1	P25578	521 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	GIP1	P38229	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	TAH18	Q12181	623 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	WHI2	P12611	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	DIT1	P21623	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	TFB1	P32776	642 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	CSE2	P33308	149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PIB2	P53191	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MAS1	P10507	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	RIT1	P23796	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MIC60	P36112	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PBY1	P38254	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MRPS18	P42847	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	LAM5	P43560	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	YGL242C	P53066	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	SUE1	Q06524	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	ESC8	Q08119	714 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PLP2	Q12017	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	HAP2	P06774	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	STE4	P18851	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	GPI10	P30777	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MNR2	P35724	969 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	AIM46	P38885	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	UME6	P39001	836 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	NUT1	P53114	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MLC1	P53141	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	FLP1	P03870	423 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	RPC31	P17890	251 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	PEX2	P32800	271 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	BRN1	P38170	754 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MED6	P38782	295 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	MCD1	Q12158	566 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YPS7	YDR349C	COQ1	P18900	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
YPS7	YDR349C	MYO3	P36006	1272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	CHS7	P38843	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	SAD1	P43589	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	FLC1	Q08967	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	MRPL16	P38064	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	NDT80	P38830	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	CHS6	P40955	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	MON1	P53129	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	RAD50	P12753	1312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	PDE1	P22434	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	UTH1	P36135	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	DUG2	P38149	878 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	RGD1	P38339	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPS7	YDR349C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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