RNA–Protein interactions for RNA: YDR349C

YPS7, Transcript of Putative GPI-anchored aspartic protease, yeastyeast

Gene YPS7, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS7YDR349C HMT1P38074 348 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C OSH3P38713 996 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C CEM1P39525 442 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C JJJ3P47138 172 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C CTR1P49573 406 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C LYS5P50113 272 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C SPO1P53541 631 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C CSI1Q04368 295 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C TY1A-DR3Q12441 440 aa5.01□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C RPS31P05759 152 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PWP2P25635 923 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C GCS1P35197 352 aa5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C ISW1P38144 1129 aa5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C TPM2P40414 161 aa5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C ALT1P52893 592 aa5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C YOL098CQ12496 1037 aa5□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PTP1P25044 335 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PGS1P25578 521 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C GIP1P38229 639 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C ECM2P38241 364 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C TAH18Q12181 623 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C WHI2P12611 486 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C DIT1P21623 536 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PRO3P32263 286 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C TFB1P32776 642 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C CSE2P33308 149 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PIB2P53191 635 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C YCS4Q06156 1176 aa4.99□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C HXK1P04806 485 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MAS1P10507 462 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C RIT1P23796 513 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MIC60P36112 540 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PBY1P38254 753 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MRPS18P42847 217 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C LAM5P43560 674 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C YGL242CP53066 181 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C ZPR1P53303 486 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C ADE12P80210 433 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C SUE1Q06524 206 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C ESC8Q08119 714 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C YOR296WQ08748 1289 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PLP2Q12017 286 aa4.98□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C HAP2P06774 265 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C STE4P18851 423 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PDC6P26263 563 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C GPI10P30777 616 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MNR2P35724 969 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C AIM46P38885 310 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C UME6P39001 836 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PSP1P50896 841 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C NUT1P53114 1132 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MLC1P53141 149 aa4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C FLP1P03870 423 aa4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C RPC31P17890 251 aa4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C PEX2P32800 271 aa4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C BRN1P38170 754 aa4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MED6P38782 295 aa4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C SBE2P42223 864 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C MCD1Q12158 566 aa4.96□□□□□ -1.61
YPS7YDR349C COQ1P18900 473 aa4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C PRP9P19736 530 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C PRE9P23638 258 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data4.96□□□□□ -1.62not detected
YPS7YDR349C MYO3P36006 1272 aa4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C CHS7P38843 316 aa4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C SAD1P43589 448 aa4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C FLC1Q08967 793 aa4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C YOR022CQ12204 715 aa4.96□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C PGK1P00560 416 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C WBP1P33767 430 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C MRPL16P38064 232 aa4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C GGA2P38817 585 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C NDT80P38830 627 aa4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C CHS6P40955 746 aa4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C MON1P53129 644 aa4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C YDL144CQ07589 356 aa4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C RAD50P12753 1312 aa4.95□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C PDE1P22434 369 aa4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C TCD2P36101 447 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C UTH1P36135 365 aa4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C DUG2P38149 878 aa4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C RGD1P38339 666 aa4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YPS7YDR349C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms