RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	TMA17	Q12513	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	MIH1	P23748	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	ATG19	P35193	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	CKB2	P38930	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	UBP5	P39944	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	ADY3	Q07732	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	THI21	Q08975	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YKR051W	P36142	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	MEF2	P39677	819 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	ZIP2	P53061	704 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	FOL1	P53848	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	GPB1	Q08886	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	SED4	P25365	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	EMC1	P25574	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	MET12	P46151	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YJR120W	P47157	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	MRC1	P25588	1096 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	PAF1	P38351	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YHR078W	P38799	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	CTF8	P38877	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	SDP1	P40479	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	SSY5	P47002	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	ECL1	P48235	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	GCN5	Q03330	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	RXT3	Q07458	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	HMI1	Q12039	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	HIS5	P07172	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	SEG2	P34250	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	FLR1	P38124	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	TDA3	P38758	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YJR008W	P47085	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	BNA2	P47125	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YGR153W	P48238	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	SPT20	P50875	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YAP6	Q03935	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	DUS4	Q06063	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	UPC2	Q12151	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	CDC6	P09119	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	EUG1	P32474	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	GRX7	P38068	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	SAK1	P38990	1142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	PZF1	P39933	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	RET2	P43621	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	VPS62	P53285	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	TRE2	Q08693	809 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	STE14	P32584	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YKR018C	P36114	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	NIT1	P40447	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYC1	YOR179C	CDC20	P26309	610 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	YBR071W	P38243	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	CHA4	P43634	648 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	NCS6	P53088	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	PCL10	P53124	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	NPC2	Q12408	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	MNN4	P36044	1178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	MSS4	P38994	779 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	VHR1	P40522	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	COG6	P53959	839 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	ASM4	Q05166	528 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	SWM1	Q12379	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	PLB1	P39105	664 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	PFA3	P42836	336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	ASI2	P53895	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	ECM9	Q02202	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	CDA2	Q06703	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	DAL3	P32459	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	BFA1	P47113	574 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	PEX14	P53112	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	RIM8	P53179	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	ORC4	P54791	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	ARP4	P80428	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYC1	YOR179C	PKH1	Q03407	766 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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