RNA–Protein interactions for RNA: YOR094W

ARF3, Transcript of Glucose-repressible ADP-ribosylation factor, yeast

Gene ARF3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARF3	YOR094W	BET3	P36149	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	SSY5	P47002	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	DAS1	P47005	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	AMA1	P50082	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	HUL5	P53119	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	MRPS35	P53292	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	MUK1	Q02866	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	ATP25	Q03153	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	THI21	Q08975	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YLR415C	O13578	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	PRC1	P00729	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	CAN1	P04817	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	ALG2	P43636	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	MUP1	P50276	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	IRC10	Q08118	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YCL002C	P25565	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	SAP190	P36123	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	PPS1	P38148	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YBR053C	P38235	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YHL017W	P38745	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	SAK1	P38990	1142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	RSC3	Q06639	885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	BDF2	Q07442	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YIR042C	P40586	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	PFA3	P42836	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	RTA1	P53047	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	NRG1	Q03125	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
ARF3	YOR094W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
ARF3	YOR094W	GAL11	P19659	1081 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	MTH1	P35198	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YJL163C	P46996	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	MET7	Q08645	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARF3	YOR094W	SPC29	P33419	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	SDS3	P40505	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	NNF1	P47149	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	GND2	P53319	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	NSE3	Q05541	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	SPC42	P36094	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	SIC1	P38634	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	HXT16	P47185	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	ZIP2	P53061	704 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	CRR1	Q05790	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	GPR1	Q12361	961 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	DIF1	O13577	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	YBR259W	P38338	688 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	SHR5	P41912	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	RIA1	P53893	1110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	TGL5	Q12043	749 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
ARF3	YOR094W	GDH3	P39708	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	ECM1	P39715	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	YML122C	Q03207	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	HOS4	P40480	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	ASM4	Q05166	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	SGO1	Q08490	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	IRC13	Q08630	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF3	YOR094W	PER1	P25625	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	FMP52	P40008	231 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	BAP3	P41815	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	ALY2	P47029	1046 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	MTC2	P34246	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	BCD1	P38772	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	PCL5	P38794	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	UBC11	P52492	156 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	YBP2	P53169	641 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	GAD1	Q04792	585 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	CDC43	P18898	376 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	ATF1	P40353	525 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	TEL2	P53038	688 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	SSL2	Q00578	843 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	BNA2	P47125	453 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	MAL11	P53048	616 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	YAP1802	P53309	568 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	RPN4	Q03465	531 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ARF3	YOR094W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69

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