RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeastyeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTR2YKR093W SDH1Q00711 640 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SSP2Q08646 371 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YOL114CQ12322 202 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W Q0142Q9ZZW4 58 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SAM35P14693 329 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W HCA4P20448 770 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CYS3P31373 394 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W MNN4P36044 1178 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SET5P38890 526 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SHR5P41912 237 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CRR1Q05790 422 aa6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W NOT3P06102 836 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W PHO81P17442 1178 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W ATP12P22135 325 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W MFT1P33441 392 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SAP190P36123 1033 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YAP1801P38856 637 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CEP3P40969 608 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W ERR3P42222 437 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W TAF1P46677 1066 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W BNA2P47125 453 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W UBA2P52488 636 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W OSW2Q12202 724 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YLR149CQ99296 730 aa6.49□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SEC65P29478 273 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YKR018CP36114 725 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YHL012WP38709 493 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CAF120P53836 1060 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SRC1Q03707 834 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CIA1Q05583 330 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data6.48□□□□□ -1.37not detected
PTR2YKR093W STE13P33894 931 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YFL052WP43551 465 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RNR4P49723 345 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W ESF2P53743 316 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YKR011CQ02209 353 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W THI21Q08975 551 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YOR022CQ12204 715 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YOL087CQ99247 1116 aa6.48□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W HSC82P15108 705 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W MDM1Q01846 1127 aa6.47□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W SVS1Q12254 260 aa6.47□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W PRC1P00729 532 aa6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W MSM1P22438 575 aa6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W GFD2P25370 566 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W JJJ3P47138 172 aa6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W MOT3P54785 490 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W ARP4P80428 489 aa6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W TRS130Q03660 1102 aa6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W OMS1Q06668 471 aa6.46□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W HOP1P20050 605 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W TRK2P28584 889 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W MCM10P32354 571 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W HOS4P40480 1083 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W ZIP2P53061 704 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W GTR1Q00582 310 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W RSC58Q07979 502 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W GAS5Q08193 484 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W HAL9Q12180 1030 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W YVC1Q12324 675 aa6.46□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W SWI6P09959 803 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W SEC18P18759 758 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W PET309P32522 965 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W RPD3P32561 433 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W BEM3P32873 1128 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W FLR1P38124 548 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W MAL31P38156 614 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W YJR039WP47107 1121 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W PCL10P53124 433 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data6.45□□□□□ -1.38not detected
PTR2YKR093W VPS30Q02948 557 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W HLR1Q04429 423 aa6.45□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W MDL2P33311 773 aa6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W MNT3P40549 630 aa6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W IML2P47031 731 aa6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W ASK10P48361 1146 aa6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W RAI1P53063 387 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W HIM1Q06674 414 aa6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W RSB1Q08417 382 aa6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W TEP1P53916 434 aa6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W YPL277CQ08989 487 aa6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W NUR1Q12066 484 aa6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W YIL092WP40497 633 aa6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W HOL1P53389 586 aa6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W NSI1Q12457 570 aa6.43□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W GLN4P13188 809 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W CDC26P14724 124 aa6.42□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W SFA1P32771 386 aa6.42□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W BEM4P39011 633 aa6.42□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W EAF5P39995 279 aa6.42□□□□□ -1.38
PTR2YKR093W VID28P40547 921 aa6.42□□□□□ -1.38
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