RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	YNL144C	P53907	740 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	GTR1	Q00582	310 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	SPC24	Q04477	213 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	PMT7	Q06644	662 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	GAL1	P04385	528 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	RAD1	P06777	1100 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	CLN2	P20438	545 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	ARG1	P22768	420 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	VPH2	P32341	215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	CBF2	P32504	956 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	ATG3	P40344	310 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	MET12	P46151	657 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	FMS1	P50264	508 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	UBA2	P52488	636 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	CWC24	P53769	259 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	IPI3	P53877	555 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	UFD2	P54860	961 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TFB2	Q02939	513 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	VPS16	Q03308	798 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	DML1	Q03652	475 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	MSH6	Q03834	1242 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	REC8	Q12188	680 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	GPR1	Q12361	961 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	OCA6	Q12454	224 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TMA17	Q12513	150 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-H	O13535	1793 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	ADR1	P07248	1323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HMS2	YJR147W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.96	□□□□□ -1.3	not detected
HMS2	YJR147W	PIF1	P07271	859 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	RSR1	P13856	272 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	THI4	P32318	326 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	MRE11	P32829	692 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	CNS1	P33313	385 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	TGL4	P36165	910 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	MDJ2	P42834	146 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	STB2	P46679	850 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	YGL176C	P46945	554 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	RPA14	P50106	137 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	YGR266W	P53326	701 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	DIP5	P53388	608 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	UBX4	P54730	416 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	ECM11	Q04110	302 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SFH1	Q06168	426 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	MDM36	Q06820	579 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	ESC8	Q08119	714 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	PGC1	Q08959	321 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	MET32	Q12041	191 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	PIN2	Q12057	282 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	DPH6	Q12429	685 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	PMS1	P14242	873 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SMC1	P32908	1225 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	PEX18	P38855	283 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	FCY21	P40039	528 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SAE2	P46946	345 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	MDV1	P47025	714 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	ERP6	P53198	216 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	SPO1	P53541	631 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	HST3	P53687	447 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	RCM1	P53972	490 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HMS2	YJR147W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3

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