RNA–Protein interactions for RNA: YHL023C

NPR3, Transcript of Subunit of SEA (Seh1-associated), Npr2/3, and Iml1p complexes, yeast

Gene NPR3, Length 3,441 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NPR3	YHL023C	APC1	P53886	1748 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	DIF1	O13577	133 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	ROG3	P43602	733 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PIP2	P52960	996 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	GPG1	P53130	126 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YPL277C	Q08989	487 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	INH1	P01097	85 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NPP1	P25353	742 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HOG1	P32485	435 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YKL222C	P35995	705 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	MSC7	P38694	644 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	EMP65	P40085	556 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	IML2	P47031	731 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	BNA2	P47125	453 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	SLD3	P53135	668 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NHX1	Q04121	633 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	OSW2	Q12202	724 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HMG1	P12683	1054 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	DAL7	P21826	554 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	SSH4	P32343	579 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	JNM1	P36224	373 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	UGA2	P38067	497 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	CCZ1	P38273	704 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	AIM21	P40563	679 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YJL045W	P47052	634 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NPY1	P53164	384 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	COG4	Q06096	861 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	RIM15	P43565	1770 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	ERS1	P17261	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	KCC4	P25389	1037 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PCL2	P25693	308 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	DID4	P36108	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	MLC2	Q06580	163 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PRC1	P00729	532 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
NPR3	YHL023C	CAF16	P43569	289 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	ATG33	Q06485	197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	SLP1	Q12232	587 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HSL7	P38274	827 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TAF1	P46677	1066 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HIM1	Q06674	414 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YKU70	P32807	602 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HIS6	P40545	261 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	CEP3	P40969	608 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TY4A-J	P47023	414 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	DSE4	P53753	1117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	ATP25	Q03153	612 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	NHA1	Q99271	985 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	GAL1	P04385	528 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	GPT2	P36148	743 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	YAP1801	P38856	637 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	PSR2	Q07949	397 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	ENV7	Q12003	364 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPR3	YHL023C	HSP78	P33416	811 aa		3.09	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	PPE1	P38796	400 aa		3.09	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	GYP7	P48365	746 aa		3.09	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	GIS4	Q04233	774 aa		3.09	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	DAL3	P32459	195 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	BIT2	P38346	545 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	VID27	P40157	782 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	TAD1	P53065	400 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	HOL1	P53389	586 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NPR3	YHL023C	NSI1	Q12457	570 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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