RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C SNT2P53127 1403 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RPN13O13563 156 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C PCL5P38794 229 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SFB2P53953 876 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C VPS30Q02948 557 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C CRR1Q05790 422 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SWM1Q12379 170 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C LTE1P07866 1435 aa3.36□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C MET10P39692 1035 aa3.35□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C GYP7P48365 746 aa3.35□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C AMA1P50082 593 aa3.35□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C YPR196WQ06595 470 aa3.35□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C VPS15P22219 1454 aa3.35□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C ULS1Q08562 1619 aa3.34□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C CDC34P14682 295 aa3.34□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data3.34□□□□□ -1.87not detected
GCN4YEL009C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SEG1Q04279 960 aa3.34□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TAF7Q05021 590 aa3.34□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C MLP2P40457 1679 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YRF1-1P0CX20 1796 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YRF1-5P0CX21 1796 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YRF1-8P0CX22 1796 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C FBP1P09201 348 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C PTP1P25044 335 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C SPO20Q04359 397 aa3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YKE2P52553 114 aa3.32□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C SSL2Q00578 843 aa3.32□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C ESC2Q06340 456 aa3.32□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C IRC20Q06554 1556 aa3.31□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YJL163CP46996 555 aa3.31□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C PDR12Q02785 1511 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C LTP1P40347 161 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C SDP1P40479 209 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C MPS1P54199 764 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C RIM13Q03792 727 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C SGO1Q08490 590 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C SPO14P36126 1683 aa3.3□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C DRS2P39524 1355 aa3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C HOM2P13663 365 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C PET112P33893 541 aa3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C MUP1P50276 574 aa3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YML020WQ03722 664 aa3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C NUP170P38181 1502 aa3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C GDB1Q06625 1536 aa3.29□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C STE13P33894 931 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C MNR2P35724 969 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C RPP1P38786 293 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C FKH2P41813 862 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C YGR053CP53234 283 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C RGT2Q12300 763 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C BNI1P41832 1953 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C TY3B-GQ99315 1547 aa3.28□□□□□ -1.88
GCN4YEL009C PDR10P51533 1564 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C HEM3P28789 327 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C NGG1P32494 702 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C CTF8P38877 133 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YJL206CP39529 758 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
GCN4YEL009C NET1P47035 1189 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C IQG1Q12280 1495 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C CAT8P39113 1433 aa3.27□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C VPS34P22543 875 aa3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C MBP1P39678 833 aa3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YEL020CP39994 560 aa3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C HSV2P50079 448 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C MMS1Q06211 1407 aa3.26□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YBT1P32386 1661 aa3.25□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YBR053CP38235 358 aa3.25□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C FAA4P47912 694 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C TAF3Q12297 353 aa3.25□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C TRM3Q07527 1436 aa3.25□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C BUD3P25558 1636 aa3.24□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YAP1802P53309 568 aa3.24□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GCN4YEL009C YLR149CQ99296 730 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8811.1 ms