RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	EFM2	P38347	419 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	NNF1	P47149	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HOP2	P53187	214 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CIK1	Q01649	594 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HEH2	Q03281	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RMD1	Q03441	430 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SVF1	Q05515	481 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	FUS2	Q05670	677 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ATG17	Q06410	417 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HIM1	Q06674	414 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	TAF10	Q12030	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RIM20	Q12033	661 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	VIK1	Q12045	647 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	DCS2	Q12123	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	GPR1	Q12361	961 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	REP1	P03871	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RPC34	P32910	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SPC42	P36094	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	YHL017W	P38745	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MET18	P40469	1032 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	STB2	P46679	850 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	VPS16	Q03308	798 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HFD1	Q04458	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HAP4	P14064	554 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SIN4	P32259	974 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SRB4	P32569	687 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	GRX4	P32642	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SEC6	P32844	805 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	YBR242W	P38331	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MAM1	P40065	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	EFM4	P40516	257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	BRO1	P48582	844 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	TEL2	P53038	688 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	DSD1	P53095	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RSM24	Q03976	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PPM1	Q04081	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SCM3	Q12334	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	WHI5	Q12416	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RTP1	Q12751	981 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RSR1	P13856	272 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SNA3	P14359	133 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	REC107	P21651	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SEC15	P22224	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	KIP1	P28742	1111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	OAF3	P36023	863 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SIP3	P38717	1229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	THI12	P42883	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	THI5	P43534	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	LAM5	P43560	674 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	YGL176C	P46945	554 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	THI11	P47183	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MDR1	P53258	950 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ESBP6	P53918	673 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ERG5	P54781	538 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ATP25	Q03153	612 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MUB1	Q03162	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	THI13	Q07748	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	OSW1	Q08692	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HIS3	P06633	220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PIF1	P07271	859 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MTF2	P10849	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CKI1	P20485	582 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.2 ms