RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrfip2Q91WK0 415 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sytl4Q9R0Q1 673 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PappaQ8R4K8 1624 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eef2kO08796 724 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif4P33174 1231 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr93Q402B2 695 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gripap1Q8VD04 806 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnh4A2A5F7 1018 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BcanQ61361 883 aa16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clca2Q8BG22 942 aa16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hmg20bQ9Z104 317 aa16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a1P04919 929 aa16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GptQ8QZR5 496 aa16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp19a1P28649 503 aa16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Asap2Q7SIG6 958 aa16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dcaf5Q80T85 946 aa16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lmbrd2Q8C561 694 aa16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nav1Q8CH77 1875 aa16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FanccP50652 591 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gsdma2Q32M21 443 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ctdnep1Q3TP92 244 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp44Q8C2S0 711 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krt25Q8VCW2 446 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trim44Q9QXA7 346 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca3Q8R420 1704 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prl7a2O54831 253 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ciao1Q99KN2 339 aa16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col22a1E9Q7P1 1613 aa16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erc1Q99MI1 1120 aa16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irgm2A0A140LIF8 407 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cers3Q1A3B0 383 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sik1Q60670 779 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd22P35329 862 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc66Q6NS45 935 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gimap5Q8BWF2 308 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem266Q8BZB3 538 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp113Q8C689 439 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 E4f1Q8CCE9 783 aa16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Amer1Q7TS75 1132 aa16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Me3Q8BMF3 604 aa16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zeb2Q9R0G7 1215 aa16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc178Q8CDV0 866 aa16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rassf8Q8CJ96 419 aa16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zbtb1Q91VL9 713 aa16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ftl2P49945 183 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Samm50Q8BGH2 469 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rdm1Q9CQK3 281 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Leo1Q5XJE5 667 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf526Q8BI66 675 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IncenpQ9WU62 880 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr182P43142 395 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2hP62257 183 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sh3bp5Q9Z131 463 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccne2Q9Z238 404 aa16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssc5dQ8BV57 1371 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TnksQ6PFX9 1320 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbxl16A2RT62 479 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zkscan8Q8BSL0 588 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aox1O54754 1333 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stat1P42225 749 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ercc3P49135 783 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm4aQ8BW72 1064 aa16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Exoc5Q3TPX4 708 aa16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zscan22Q8BGS5 496 aa16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cops6O88545 324 aa16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slfnl1Q8BHW9 410 aa16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TsksO54887 585 aa16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pcmtd1P59913 357 aa16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Jmjd4Q8BFT6 427 aa16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr24Q8CFJ9 790 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.7 ms