Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Fbxl16A2RT62 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Fbxl16A2RT62 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Fbxl16A2RT62 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Fbxl16A2RT62 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Fbxl16A2RT62 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Fbxl16A2RT62 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Fbxl16A2RT62 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Fbxl16A2RT62 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fbxl16A2RT62 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Fbxl16A2RT62 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Fbxl16A2RT62 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fbxl16A2RT62 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Fbxl16A2RT62 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Fbxl16A2RT62 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fbxl16A2RT62 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fbxl16A2RT62 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fbxl16A2RT62 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fbxl16A2RT62 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fbxl16A2RT62 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fbxl16A2RT62 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fbxl16A2RT62 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fbxl16A2RT62 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fbxl16A2RT62 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Fbxl16A2RT62 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Fbxl16A2RT62 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Fbxl16A2RT62 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fbxl16A2RT62 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fbxl16A2RT62 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fbxl16A2RT62 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fbxl16A2RT62 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fbxl16A2RT62 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fbxl16A2RT62 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fbxl16A2RT62 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fbxl16A2RT62 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fbxl16A2RT62 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Fbxl16A2RT62 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fbxl16A2RT62 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fbxl16A2RT62 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Fbxl16A2RT62 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fbxl16A2RT62 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fbxl16A2RT62 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fbxl16A2RT62 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fbxl16A2RT62 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fbxl16A2RT62 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Fbxl16A2RT62 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fbxl16A2RT62 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fbxl16A2RT62 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fbxl16A2RT62 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fbxl16A2RT62 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fbxl16A2RT62 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fbxl16A2RT62 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fbxl16A2RT62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fbxl16A2RT62 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fbxl16A2RT62 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fbxl16A2RT62 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fbxl16A2RT62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fbxl16A2RT62 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fbxl16A2RT62 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Fbxl16A2RT62 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fbxl16A2RT62 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fbxl16A2RT62 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fbxl16A2RT62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Fbxl16A2RT62 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fbxl16A2RT62 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Fbxl16A2RT62 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fbxl16A2RT62 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Fbxl16A2RT62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Fbxl16A2RT62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Fbxl16A2RT62 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Fbxl16A2RT62 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fbxl16A2RT62 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fbxl16A2RT62 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fbxl16A2RT62 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fbxl16A2RT62 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fbxl16A2RT62 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fbxl16A2RT62 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fbxl16A2RT62 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fbxl16A2RT62 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fbxl16A2RT62 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fbxl16A2RT62 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fbxl16A2RT62 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxl16A2RT62 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fbxl16A2RT62 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fbxl16A2RT62 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fbxl16A2RT62 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fbxl16A2RT62 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fbxl16A2RT62 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fbxl16A2RT62 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fbxl16A2RT62 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fbxl16A2RT62 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Fbxl16A2RT62 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fbxl16A2RT62 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fbxl16A2RT62 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fbxl16A2RT62 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fbxl16A2RT62 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fbxl16A2RT62 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fbxl16A2RT62 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fbxl16A2RT62 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fbxl16A2RT62 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms