Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.93■■■■■ 5.58
Slfnl1Q8BHW9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Slfnl1Q8BHW9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Slfnl1Q8BHW9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
Slfnl1Q8BHW9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Slfnl1Q8BHW9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Slfnl1Q8BHW9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Slfnl1Q8BHW9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Slfnl1Q8BHW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Slfnl1Q8BHW9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Slfnl1Q8BHW9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Slfnl1Q8BHW9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Slfnl1Q8BHW9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Slfnl1Q8BHW9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Slfnl1Q8BHW9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Slfnl1Q8BHW9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Slfnl1Q8BHW9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Slfnl1Q8BHW9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Slfnl1Q8BHW9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Slfnl1Q8BHW9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Slfnl1Q8BHW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Slfnl1Q8BHW9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Slfnl1Q8BHW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Slfnl1Q8BHW9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Slfnl1Q8BHW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Slfnl1Q8BHW9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Slfnl1Q8BHW9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Slfnl1Q8BHW9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Slfnl1Q8BHW9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Slfnl1Q8BHW9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Slfnl1Q8BHW9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Slfnl1Q8BHW9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Slfnl1Q8BHW9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Slfnl1Q8BHW9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Slfnl1Q8BHW9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Slfnl1Q8BHW9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Slfnl1Q8BHW9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Slfnl1Q8BHW9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Slfnl1Q8BHW9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Slfnl1Q8BHW9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Slfnl1Q8BHW9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Slfnl1Q8BHW9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Slfnl1Q8BHW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Slfnl1Q8BHW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Slfnl1Q8BHW9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Slfnl1Q8BHW9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Slfnl1Q8BHW9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Slfnl1Q8BHW9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Slfnl1Q8BHW9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Slfnl1Q8BHW9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Slfnl1Q8BHW9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Slfnl1Q8BHW9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Slfnl1Q8BHW9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Slfnl1Q8BHW9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Slfnl1Q8BHW9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Slfnl1Q8BHW9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Slfnl1Q8BHW9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slfnl1Q8BHW9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slfnl1Q8BHW9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Slfnl1Q8BHW9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Slfnl1Q8BHW9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Slfnl1Q8BHW9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slfnl1Q8BHW9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Slfnl1Q8BHW9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Slfnl1Q8BHW9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Slfnl1Q8BHW9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Slfnl1Q8BHW9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Slfnl1Q8BHW9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Slfnl1Q8BHW9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Slfnl1Q8BHW9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Slfnl1Q8BHW9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Slfnl1Q8BHW9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Slfnl1Q8BHW9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Slfnl1Q8BHW9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Slfnl1Q8BHW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Slfnl1Q8BHW9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Slfnl1Q8BHW9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Slfnl1Q8BHW9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Slfnl1Q8BHW9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Slfnl1Q8BHW9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Slfnl1Q8BHW9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Slfnl1Q8BHW9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slfnl1Q8BHW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Slfnl1Q8BHW9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Slfnl1Q8BHW9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Slfnl1Q8BHW9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Slfnl1Q8BHW9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Slfnl1Q8BHW9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Slfnl1Q8BHW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Slfnl1Q8BHW9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Slfnl1Q8BHW9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Slfnl1Q8BHW9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Slfnl1Q8BHW9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Slfnl1Q8BHW9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Slfnl1Q8BHW9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Slfnl1Q8BHW9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Slfnl1Q8BHW9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Slfnl1Q8BHW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Slfnl1Q8BHW9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms