RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nphp3Q7TNH6 1325 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm45015A0A140LII9 184 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm18336A0A140LIU8 765 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prr5lA2AVJ5 370 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cops6O88545 324 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asap2Q7SIG6 958 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr3dQ91WD1 398 aa23.74■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vps33bP59016 617 aa23.73■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klc3Q91W40 508 aa23.73■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bmp2kQ91Z96 1138 aa23.73■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cacna1sQ02789 1880 aa23.73■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc4a1P04919 929 aa23.72■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bsdc1Q80Y55 427 aa23.72■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9D9S1 216 aa23.72■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ftl2P49945 183 aa23.72■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nek11Q8C0Q4 628 aa23.72■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt25Q8VCW2 446 aa23.72■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pus3Q9JI38 481 aa23.72■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Greb1lB9EJV3 1913 aa23.71■■□□□ 1.39
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cpa2Q504N0 417 aa23.71■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem266Q8BZB3 538 aa23.7■■□□□ 1.38
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxo4Q9WVH3 505 aa23.7■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PogkQ80TC5 607 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mb21d2Q8C525 428 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Syt1P46096 421 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zbtb38Q3LR78 1197 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Esco1Q69Z69 843 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zkscan8Q8BSL0 588 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cchcr1Q8K2I2 770 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tceanc2Q8R2M0 207 aa23.69■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2d10P24456 504 aa23.68■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RubcnlQ3TD16 648 aa23.68■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnf20Q5DTM8 973 aa23.68■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kank4Q6P9J5 1016 aa23.68■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sp8Q8BMJ8 486 aa23.68■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myh1Q5SX40 1942 aa23.68■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp7a1Q64505 503 aa23.68■■□□□ 1.38
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1700006A11RikB9EHI3 544 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TnksQ6PFX9 1320 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp8a2P98200 1148 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slf2Q6P9P0 1278 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rdm1Q9CQK3 281 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa23.65■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa23.65■■□□□ 1.38
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Erc1Q99MI1 1120 aa23.65■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmg20bQ9Z104 317 aa23.65■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccne2Q9Z238 404 aa23.65■■□□□ 1.38
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vsig10D3YX43 558 aa23.64■■□□□ 1.38
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim34aQ99PP6 485 aa23.62■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrp5Q91VN0 1614 aa23.62■■□□□ 1.37
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ifit1bl2Q3U687 466 aa23.61■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trip6Q9Z1Y4 480 aa23.61■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lama4P97927 1816 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dctn1O08788 1281 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cypt2Q6P924 180 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmx3Q8BXZ1 456 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bin2D3Z6Q9 489 aa23.6■■□□□ 1.37
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp44Q8C2S0 711 aa23.6■■□□□ 1.37
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