Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
Myh1Q5SX40 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Myh1Q5SX40 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Myh1Q5SX40 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
Myh1Q5SX40 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Myh1Q5SX40 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Myh1Q5SX40 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Myh1Q5SX40 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Myh1Q5SX40 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Myh1Q5SX40 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Myh1Q5SX40 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Myh1Q5SX40 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Myh1Q5SX40 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Myh1Q5SX40 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Myh1Q5SX40 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Myh1Q5SX40 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Myh1Q5SX40 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Myh1Q5SX40 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Myh1Q5SX40 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Myh1Q5SX40 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Myh1Q5SX40 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Myh1Q5SX40 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Myh1Q5SX40 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Myh1Q5SX40 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Myh1Q5SX40 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Myh1Q5SX40 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Myh1Q5SX40 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Myh1Q5SX40 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Myh1Q5SX40 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myh1Q5SX40 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Myh1Q5SX40 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Myh1Q5SX40 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Myh1Q5SX40 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Myh1Q5SX40 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Myh1Q5SX40 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Myh1Q5SX40 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Myh1Q5SX40 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Myh1Q5SX40 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Myh1Q5SX40 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Myh1Q5SX40 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Myh1Q5SX40 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Myh1Q5SX40 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Myh1Q5SX40 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Myh1Q5SX40 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Myh1Q5SX40 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Myh1Q5SX40 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Myh1Q5SX40 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Myh1Q5SX40 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Myh1Q5SX40 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Myh1Q5SX40 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Myh1Q5SX40 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Myh1Q5SX40 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Myh1Q5SX40 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Myh1Q5SX40 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Myh1Q5SX40 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Myh1Q5SX40 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Myh1Q5SX40 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Myh1Q5SX40 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Myh1Q5SX40 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Myh1Q5SX40 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Myh1Q5SX40 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Myh1Q5SX40 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Myh1Q5SX40 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Myh1Q5SX40 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Myh1Q5SX40 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Myh1Q5SX40 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Myh1Q5SX40 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Myh1Q5SX40 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Myh1Q5SX40 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Myh1Q5SX40 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Myh1Q5SX40 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Myh1Q5SX40 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Myh1Q5SX40 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Myh1Q5SX40 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Myh1Q5SX40 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Myh1Q5SX40 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Myh1Q5SX40 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Myh1Q5SX40 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Myh1Q5SX40 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Myh1Q5SX40 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Myh1Q5SX40 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Myh1Q5SX40 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Myh1Q5SX40 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Myh1Q5SX40 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Myh1Q5SX40 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Myh1Q5SX40 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Myh1Q5SX40 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Myh1Q5SX40 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Myh1Q5SX40 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Myh1Q5SX40 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Myh1Q5SX40 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Myh1Q5SX40 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Myh1Q5SX40 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Myh1Q5SX40 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Myh1Q5SX40 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Myh1Q5SX40 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Myh1Q5SX40 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Myh1Q5SX40 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Myh1Q5SX40 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Myh1Q5SX40 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms