Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
RubcnlQ3TD16 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RubcnlQ3TD16 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RubcnlQ3TD16 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RubcnlQ3TD16 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RubcnlQ3TD16 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
RubcnlQ3TD16 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
RubcnlQ3TD16 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
RubcnlQ3TD16 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RubcnlQ3TD16 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
RubcnlQ3TD16 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
RubcnlQ3TD16 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RubcnlQ3TD16 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RubcnlQ3TD16 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RubcnlQ3TD16 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RubcnlQ3TD16 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RubcnlQ3TD16 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RubcnlQ3TD16 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RubcnlQ3TD16 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RubcnlQ3TD16 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RubcnlQ3TD16 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RubcnlQ3TD16 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RubcnlQ3TD16 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RubcnlQ3TD16 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RubcnlQ3TD16 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
RubcnlQ3TD16 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RubcnlQ3TD16 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RubcnlQ3TD16 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RubcnlQ3TD16 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RubcnlQ3TD16 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RubcnlQ3TD16 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RubcnlQ3TD16 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RubcnlQ3TD16 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RubcnlQ3TD16 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RubcnlQ3TD16 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RubcnlQ3TD16 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RubcnlQ3TD16 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
RubcnlQ3TD16 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RubcnlQ3TD16 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RubcnlQ3TD16 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RubcnlQ3TD16 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RubcnlQ3TD16 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RubcnlQ3TD16 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RubcnlQ3TD16 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RubcnlQ3TD16 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RubcnlQ3TD16 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
RubcnlQ3TD16 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RubcnlQ3TD16 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RubcnlQ3TD16 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RubcnlQ3TD16 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RubcnlQ3TD16 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RubcnlQ3TD16 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RubcnlQ3TD16 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RubcnlQ3TD16 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RubcnlQ3TD16 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RubcnlQ3TD16 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RubcnlQ3TD16 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RubcnlQ3TD16 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RubcnlQ3TD16 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RubcnlQ3TD16 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RubcnlQ3TD16 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RubcnlQ3TD16 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RubcnlQ3TD16 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RubcnlQ3TD16 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RubcnlQ3TD16 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RubcnlQ3TD16 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RubcnlQ3TD16 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RubcnlQ3TD16 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RubcnlQ3TD16 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RubcnlQ3TD16 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RubcnlQ3TD16 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RubcnlQ3TD16 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RubcnlQ3TD16 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RubcnlQ3TD16 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RubcnlQ3TD16 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RubcnlQ3TD16 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RubcnlQ3TD16 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RubcnlQ3TD16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RubcnlQ3TD16 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RubcnlQ3TD16 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RubcnlQ3TD16 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RubcnlQ3TD16 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RubcnlQ3TD16 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RubcnlQ3TD16 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RubcnlQ3TD16 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RubcnlQ3TD16 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RubcnlQ3TD16 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RubcnlQ3TD16 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RubcnlQ3TD16 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RubcnlQ3TD16 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RubcnlQ3TD16 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RubcnlQ3TD16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RubcnlQ3TD16 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RubcnlQ3TD16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RubcnlQ3TD16 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RubcnlQ3TD16 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RubcnlQ3TD16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RubcnlQ3TD16 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RubcnlQ3TD16 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RubcnlQ3TD16 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms