RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P TRS130Q03660 1102 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS20Q04272 221 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC10Q08118 586 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PSK2Q08217 1101 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ELG1Q12050 791 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P OSH2Q12451 1283 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RRD2Q12461 358 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P APE1P14904 514 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO11P23179 398 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RPC53P25441 422 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC15P27636 974 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P DPH2P32461 534 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS35P34110 944 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YEL1P34225 687 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P COY1P34237 679 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SEG2P34250 1132 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MAL33P38157 468 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YAP1801P38856 637 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL034WP43564 1073 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P VTC2P43585 828 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR153WP48238 217 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CDD1Q06549 142 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P FMP25Q08023 583 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TLG2Q08144 397 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL216WQ08964 1102 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PLP2Q12017 286 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MYO1P08964 1928 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CAN1P04817 590 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HAP2P06774 265 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ALG1P16661 449 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P KGD2P19262 463 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PGS1P25578 521 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RDS1P25611 832 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P URA1P28272 314 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ASF1P32447 279 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CBF2P32504 956 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD54P32863 898 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RPT1P33299 467 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MAP2P38174 421 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SIP5P40210 489 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ULI1P43604 169 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P FAA4P47912 694 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CCM1P48237 864 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ISM1P48526 1002 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SPC98P53540 846 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P STP1Q00947 519 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TBF1Q02457 562 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PML39Q03760 334 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P COG8Q04632 607 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P FUS2Q05670 677 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM7Q06200 448 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL057WQ07379 328 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SAM3Q08986 587 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P UBR2Q07963 1872 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P FOB1O13329 566 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ASP3-2P0CX77 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ASP3-3P0CX78 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ASP3-4P0CX79 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ASP3-1P0CZ17 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CKA2P19454 339 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P IME1P21190 360 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS3P23643 1011 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SGF29P25554 259 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX34P25584 144 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YSC83P32792 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P MNN4P36044 1178 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR056WP38081 501 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TBS1P38114 1094 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MMS4P38257 691 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SIF2P38262 535 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HXT5P38695 592 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MED6P38782 295 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P UBP5P39944 805 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YEL023CP39992 682 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP82P40368 713 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ROG3P43602 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P POL31P46957 487 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P NPA3P47122 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SFB2P53953 876 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YHM2Q04013 314 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL277CQ08989 487 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.8 ms