RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D YNL018CP53976 612 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D LCD1Q04377 747 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ADY4Q05955 493 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YPL277CQ08989 487 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF10Q12030 206 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D REC8Q12188 680 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D NCR1Q12200 1170 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MED1Q12321 566 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PRC1P00729 532 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D MAK16P10962 306 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD27P26793 382 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D URK1P27515 501 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CYS3P31373 394 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D RPT1P33299 467 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TRM2P33753 639 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS24P36095 224 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PGM2P37012 569 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CCL1P37366 393 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D RDH54P38086 958 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PPS1P38148 807 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D VID24P38263 362 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D STB5P38699 743 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D BDH2P39713 417 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D FTR1P40088 404 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D MOB1P40484 314 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D YFL052WP43551 465 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS25P47142 202 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D MNP1P53163 194 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D ART5P53244 586 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D HST1P53685 503 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data3.58□□□□□ -1.84not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data3.58□□□□□ -1.84not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TLG2Q08144 397 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D YOR022CQ12204 715 aa3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D DDP1Q99321 188 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF13P11747 167 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D HMG2P12684 1045 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CDC15P27636 974 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PRR1P28708 518 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D TSA1P34760 196 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D HMT1P38074 348 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CCC2P38995 1004 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D NPP2P39997 493 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D YER186CP40101 306 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CIR1P42940 261 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D LSB6P42951 607 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D FYV8P46949 817 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D POL31P46957 487 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D SMC3P47037 1230 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D AVT1P47082 602 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D HSH155P49955 971 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D INP52P50942 1183 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TAM41P53230 385 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D ARK1P53974 638 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PNG1Q02890 363 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TRS130Q03660 1102 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D HRQ1Q05549 1077 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D DON1Q05610 365 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PIG1Q06216 648 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PSR2Q07949 397 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D PUS1Q12211 544 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D OSH2Q12451 1283 aa3.57□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TOM70P07213 617 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D ASP3-2P0CX77 362 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D ASP3-3P0CX78 362 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D ASP3-4P0CX79 362 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D ASP3-1P0CZ17 362 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D CHS2P14180 963 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D OM45P16547 393 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D VMA1P17255 1071 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D DAL7P21826 554 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D MBR1P23493 339 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D MUD1P32605 298 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D APM2P38700 605 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TGL3P40308 642 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D SAD1P43589 448 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF1P46677 1066 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D DAS1P47005 663 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D YJL045WP47052 634 aa3.56□□□□□ -1.84
tK(UUU)DtK(UUU)D NPA3P47122 385 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.5 ms