RNA–Protein interactions for RNA: YOR238W

YOR238W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YOR238W, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR238W	YOR238W	CTF4	Q01454	927 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	RIP-Chip
YOR238W	YOR238W	NPC2	Q12408	173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	PET10	P36139	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	OCA5	P38738	679 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	EXG2	P52911	562 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	KIN4	Q01919	800 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YOR238W	YOR238W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	NPP1	P25353	742 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	TOK1	P40310	691 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
YOR238W	YOR238W	TAF8	Q03750	510 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	CAN1	P04817	590 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	NPP2	P39997	493 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	CEP3	P40969	608 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	MPH2	P0CD99	609 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	SED4	P25365	1065 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	PUS2	P53167	370 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	SLI1	P53304	468 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	RPN4	Q03465	531 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	AFR1	P33304	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	STE13	P33894	931 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	YKE2	P52553	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	NCS6	P53088	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	DAM1	P53267	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	ENB1	Q08299	606 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	TOP3	P13099	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	ALG2	P43636	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	YTA7	P40340	1379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	KAR4	P25583	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	SAP190	P36123	1033 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	ERT1	P38140	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	CHS7	P38843	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	UBA2	P52488	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR238W	YOR238W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
YOR238W	YOR238W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	SUL1	P38359	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	REH1	Q06709	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	GUP2	Q08929	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	RAD53	P22216	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	EMC3	P36039	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	BET3	P36149	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
YOR238W	YOR238W	ENV7	Q12003	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	UPC2	Q12151	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	PHO8	P11491	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	DAL7	P21826	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	RPD3	P32561	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	TIM23	P32897	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	NUP82	P40368	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	SHR5	P41912	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	RTA1	P53047	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	PRC1	P00729	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	GSY1	P23337	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	OAR1	P35731	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	KTR4	P38131	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	MOH1	P38191	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	SWM1	Q12379	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	LAS17	Q12446	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	ERG4	P25340	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	THI4	P32318	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	NGG1	P32494	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	PPG1	P32838	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	GYP8	P43570	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	TAD1	P53065	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR238W	YOR238W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YOR238W	YOR238W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR238W	YOR238W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR238W	YOR238W	SPC29	P33419	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR238W	YOR238W	GDH3	P39708	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR238W	YOR238W	SDP1	P40479	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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