RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MGR3	YMR115W	ARE1	P25628	610 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MGR3	YMR115W	SCT1	P32784	759 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MGR3	YMR115W	OSH2	Q12451	1283 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MGR3	YMR115W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	PET10	P36139	283 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	BUL1	P48524	976 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	HDA1	P53973	706 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	CTF4	Q01454	927 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	SDP1	P40479	209 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.2	□□□□□ -1.42	not detected
MGR3	YMR115W	YKR011C	Q02209	353 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	TOP3	P13099	656 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	CEP3	P40969	608 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	TIM54	P47045	478 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	CIT1	P00890	479 aa		6.18	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	ENV7	Q12003	364 aa		6.18	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	AIM44	Q99299	758 aa		6.18	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	CTF8	P38877	133 aa		6.17	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	YGR125W	P53273	1036 aa		6.17	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	MPH2	P0CD99	609 aa		6.16	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	YJL049W	P47048	450 aa		6.16	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	YLR040C	Q07988	224 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MGR3	YMR115W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.15	□□□□□ -1.43	not detected
MGR3	YMR115W	ERG5	P54781	538 aa		6.15	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	TAF8	Q03750	510 aa		6.15	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	PEX19	Q07418	342 aa		6.15	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	KTR4	P38131	464 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	FLC1	Q08967	793 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	ERG4	P25340	473 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	HUL4	P40985	892 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	HUL5	P53119	910 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	SUL1	P38359	859 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	NIT3	P49954	291 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	PUS2	P53167	370 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	YOL073C	Q08232	322 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	SWM1	Q12379	170 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	YHR078W	P38799	552 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	CTF13	P35203	478 aa		6.1	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	EMC3	P36039	253 aa		6.1	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	BET3	P36149	193 aa		6.1	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	TRM13	Q12383	476 aa		6.1	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	RAD53	P22216	821 aa		6.09	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	GYP8	P43570	497 aa		6.09	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	BDF2	Q07442	638 aa		6.09	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	TRM11	Q12463	433 aa		6.09	□□□□□ -1.43
MGR3	YMR115W	DAL7	P21826	554 aa		6.09	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	OAR1	P35731	278 aa		6.09	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	RTA1	P53047	317 aa		6.09	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	HAL9	Q12180	1030 aa		6.09	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	MOH1	P38191	138 aa		6.08	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	CAN1	P04817	590 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	TAD1	P53065	400 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	DAM1	P53267	343 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	RNT1	Q02555	471 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	PPM2	Q08282	695 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	YOR022C	Q12204	715 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	YCL002C	P25565	263 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	VHR1	P40522	640 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	ALG2	P43636	503 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	NNF1	P47149	201 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	NSE3	Q05541	303 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	ALG7	P07286	448 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	RPP1	P38786	293 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	ASI2	P53895	289 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
MGR3	YMR115W	GAL11	P19659	1081 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	PRC1	P00729	532 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	MRPS35	P53292	345 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.03	□□□□□ -1.44	not detected
MGR3	YMR115W	FKH2	P41813	862 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	DLT1	Q04216	342 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MGR3	YMR115W	YDR514C	Q04408	483 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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