RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	SVF1	Q05515	481 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	TIM44	Q01852	431 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	TPO2	P53283	614 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	IRC10	Q08118	586 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CSI1	YMR025W	STE5	P32917	917 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	CTF13	P35203	478 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	CTF8	P38877	133 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	IRR1	P40541	1150 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	VAC8	P39968	578 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	TOK1	P40310	691 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	CEP3	P40969	608 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	HDA1	P53973	706 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	MTH1	P35198	433 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	GND2	P53319	492 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	FRE5	Q08908	694 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	SWM1	Q12379	170 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	TRM11	Q12463	433 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	ATF1	P40353	525 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	LCD1	Q04377	747 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	MET3	P08536	511 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	PPS1	P38148	807 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	REC104	P33323	182 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	SPC42	P36094	363 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	YBR184W	P38299	523 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	ELO3	P40319	345 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	DLT1	Q04216	342 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	YHR078W	P38799	552 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	PFD1	P46988	109 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CSI1	YMR025W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	RPP1	P38786	293 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	FKH2	P41813	862 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	MRPS35	P53292	345 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	YBR284W	P38150	797 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	SDS3	P40505	327 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	ALR2	P43553	858 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	MUP1	P50276	574 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	ADY4	Q05955	493 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	FMP25	Q08023	583 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	YHL017W	P38745	532 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	VHR1	P40522	640 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	DAS1	P47005	663 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	PUS2	P53167	370 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	CDC11	P32458	415 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	BDF2	Q07442	638 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	MPH2	P0CD99	609 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.84	□□□□□ -1.47	not detected
CSI1	YMR025W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	ASI2	P53895	289 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	ENV7	Q12003	364 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CSI1	YMR025W	PET10	P36139	283 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	UBX5	Q06682	500 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.83	□□□□□ -1.48	not detected
CSI1	YMR025W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	YBR053C	P38235	358 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	PKH1	Q03407	766 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	YJL163C	P46996	555 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	CRR1	Q05790	422 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	EAF1	Q06337	982 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	SUT2	Q12286	268 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	SCT1	P32784	759 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	PCL5	P38794	229 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	PZF1	P39933	429 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	AMA1	P50082	593 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	ERP6	P53198	216 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	SPO75	Q07798	868 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CSI1	YMR025W	TOP3	P13099	656 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSI1	YMR025W	DAL7	P21826	554 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSI1	YMR025W	TDP1	P38319	544 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSI1	YMR025W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49

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