RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	SIT1	P39980	628 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	MRPS35	P53292	345 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	HDA1	P53973	706 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	GIS1	Q03833	894 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	PEX19	Q07418	342 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	ERG5	P54781	538 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	LCD1	Q04377	747 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	FBP1	P09201	348 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	REC104	P33323	182 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	SDP1	P40479	209 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	STB4	P50104	949 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	EAF1	Q06337	982 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	RAD4	P14736	754 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	ARE1	P25628	610 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	OAR1	P35731	278 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	GUP2	Q08929	609 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKL063C	YKL063C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	UBA2	P52488	636 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	RIP-Chip
YKL063C	YKL063C	VPS30	Q02948	557 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	ALG7	P07286	448 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	YCL002C	P25565	263 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	CTF8	P38877	133 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	TPO2	P53283	614 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	ENV7	Q12003	364 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	PET10	P36139	283 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	KTR4	P38131	464 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	VHR1	P40522	640 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	FKH2	P41813	862 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	TMN2	Q04562	672 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	CTF13	P35203	478 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	PPS1	P38148	807 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	YHR078W	P38799	552 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	PUS2	P53167	370 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	RNT1	Q02555	471 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	SWM1	Q12379	170 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	DAL7	P21826	554 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	RPP1	P38786	293 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	TIM54	P47045	478 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	ERP6	P53198	216 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	MCH5	Q08777	521 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	CDC11	P32458	415 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	BET3	P36149	193 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	GYP8	P43570	497 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	TAD1	P53065	400 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	SPO75	Q07798	868 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	FRE5	Q08908	694 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKL063C	YKL063C	SAK1	P38990	1142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	ELO3	P40319	345 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	MUP1	P50276	574 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	GND2	P53319	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	ASM4	Q05166	528 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	MTH1	P35198	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	YML122C	Q03207	126 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	TRM11	Q12463	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	CIT1	P00890	479 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	YPT53	P36019	220 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	RTA1	P53047	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	HUL5	P53119	910 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	TAF8	Q03750	510 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	DLT1	Q04216	342 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	OMS1	Q06668	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	ACF2	Q12168	779 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	PRC1	P00729	532 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	SPC42	P36094	363 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	SSY5	P47002	699 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	ASI2	P53895	289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	FLC1	Q08967	793 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	MET3	P08536	511 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	SAP190	P36123	1033 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.7 ms