RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	CHA4	P43634	648 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	NIT3	P49954	291 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	CEP3	P40969	608 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	ALG2	P43636	503 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
CSE4	YKL049C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	NPC2	Q12408	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	YTA7	P40340	1379 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	RPD3	P32561	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	TIM23	P32897	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	BUD6	P41697	788 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	NCS6	P53088	359 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	UPC2	Q12151	913 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	SED4	P25365	1065 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	EMC3	P36039	253 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	GYP8	P43570	497 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	DAM1	P53267	343 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	HDA1	P53973	706 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
CSE4	YKL049C	NUP82	P40368	713 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	TAD1	P53065	400 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	PUS2	P53167	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	FBP1	P09201	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	DAL7	P21826	554 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	HCM1	P25364	564 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	STE14	P32584	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	GDH3	P39708	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	SDP1	P40479	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	OSW7	P43611	510 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	EXG2	P52911	562 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	GIS1	Q03833	894 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	CIT2	P08679	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PHO8	P11491	566 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	DCG1	P32460	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SPC29	P33419	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	CTF8	P38877	133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	REH1	Q06709	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	MET7	Q08645	548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	RAD53	P22216	821 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	KAR4	P25583	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SAP190	P36123	1033 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PHO23	P50947	330 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	MAL11	P53048	616 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	ATP25	Q03153	612 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	GUP2	Q08929	609 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	NTO1	Q12311	748 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PRC1	P00729	532 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	YCL002C	P25565	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	YHR078W	P38799	552 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	ENB1	Q08299	606 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PER1	P25625	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	THI4	P32318	326 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	TRM2	P33753	639 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	LAS17	Q12446	633 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SHR5	P41912	237 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	RSC3	Q06639	885 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	PEX19	Q07418	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SWM1	Q12379	170 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	MSS4	P38994	779 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	DSS1	P39112	969 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	ALY2	P47029	1046 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	MDM12	Q92328	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSE4	YKL049C	DIF1	O13577	133 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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