RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	TOK1	P40310	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	HUL4	P40985	892 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	BUD6	P41697	788 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	REV3	P14284	1504 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	GAL11	P19659	1081 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	PET10	P36139	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	TIM23	P32897	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	REC104	P33323	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	NUP82	P40368	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	VPS30	Q02948	557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	STE13	P33894	931 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	PHO23	P50947	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	TAF2	P23255	1407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	HCM1	P25364	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	DCG1	P32460	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	EXG2	P52911	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	NCS6	P53088	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	NTO1	Q12311	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	SIN3	P22579	1536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	KOG1	P38873	1557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	SSK2	P53599	1579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	LAS17	Q12446	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG27	YJL178C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
ATG27	YJL178C	RNH70	P53331	553 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ENV7	Q12003	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	UPC2	Q12151	913 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	NPC2	Q12408	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
ATG27	YJL178C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	PHO8	P11491	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	RPD3	P32561	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	STE14	P32584	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	TRM2	P33753	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	GDH3	P39708	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	GYP8	P43570	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	NIT3	P49954	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	GUP2	Q08929	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	FBP1	P09201	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	SED4	P25365	1065 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ALG2	P43636	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	MAL11	P53048	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	SLI1	P53304	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	SUN4	P53616	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ENB1	Q08299	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	PUS9	Q12069	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	EMC3	P36039	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	CEP3	P40969	608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	OSW7	P43611	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	HDA1	P53973	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ATG2	P53855	1592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	RAD53	P22216	821 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	KAR4	P25583	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	THI4	P32318	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	PPG1	P32838	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	MSS4	P38994	779 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	SDP1	P40479	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	BUL1	P48524	976 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	MSE1	P48525	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	DAM1	P53267	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	BUD4	P47136	1447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	YCL002C	P25565	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	CTF8	P38877	133 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG27	YJL178C	ALG12	P53730	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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