RNA–Protein interactions for RNA: YHR181W

SVP26, Transcript of Integral membrane protein of the early Golgi apparatus and ER, yeast

Gene SVP26, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVP26	YHR181W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
SVP26	YHR181W	CHA4	P43634	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	NIT3	P49954	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	DAM1	P53267	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	YAP6	Q03935	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	RAD53	P22216	821 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	THI4	P32318	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	RPD3	P32561	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	PPG1	P32838	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	SPC29	P33419	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	ATG19	P35193	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	CEP3	P40969	608 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	ALG12	P53730	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	VPS30	Q02948	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVP26	YHR181W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	FBP1	P09201	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	MSH2	P25847	964 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	ATP25	Q03153	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	DAL7	P21826	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	PLB1	P39105	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	MET7	Q08645	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	UPC2	Q12151	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	MDM12	Q92328	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	YLR358C	O13565	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	LST4	P34239	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	TAD1	P53065	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	NCS6	P53088	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	YCL002C	P25565	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	STE14	P32584	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	FLR1	P38124	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SVP26	YHR181W	UGO1	Q03327	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	REH1	Q06709	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	MEF1	P25039	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	SED4	P25365	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	PEX6	P33760	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	CTF8	P38877	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	RSC3	Q06639	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	PER1	P25625	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	MTC2	P34246	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	SDP1	P40479	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	TMA10	Q06177	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	NTG2	Q08214	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	NPC2	Q12408	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVP26	YHR181W	CDC9	P04819	755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	DSS1	P39112	969 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	HXT16	P47185	567 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	PUS2	P53167	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	ESC8	Q08119	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	GSY1	P23337	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	STE11	P23561	717 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	VBA3	P25594	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SVP26	YHR181W	TAF1	P46677	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	EXG2	P52911	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	PRC1	P00729	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	SAP190	P36123	1033 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	MNN1	P39106	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	THI21	Q08975	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	KAR4	P25583	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	MCD4	P36051	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	YHR078W	P38799	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	CAF16	P43569	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	AIM44	Q99299	758 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	SRD1	P09007	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	CTS1	P29029	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVP26	YHR181W	DCG1	P32460	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms