RNA–Protein interactions for RNA: YGR035C

YGR035C, Transcript of Putative protein of unknown function, potential Cdc28p substrate, yeast

Gene YGR035C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR035C	YGR035C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	MTH1	P35198	433 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	MRP8	P35719	219 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	PBY1	P38254	753 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	CEP3	P40969	608 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	GND2	P53319	492 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	STE5	P32917	917 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	CTF13	P35203	478 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	SPC42	P36094	363 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	VAC8	P39968	578 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	SWM1	Q12379	170 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	PPS1	P38148	807 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	CTF8	P38877	133 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	SIT1	P39980	628 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	IRR1	P40541	1150 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	HDA1	P53973	706 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	YKR011C	Q02209	353 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	FRE5	Q08908	694 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	TRM11	Q12463	433 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	MET3	P08536	511 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	TOK1	P40310	691 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	ATF1	P40353	525 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	DLT1	Q04216	342 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	LCD1	Q04377	747 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	SVF1	Q05515	481 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	YPR071W	Q12346	211 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	REC104	P33323	182 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	YBR184W	P38299	523 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	ELO3	P40319	345 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	FKH2	P41813	862 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	TPO2	P53283	614 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	YBR284W	P38150	797 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	RPP1	P38786	293 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	MRPS35	P53292	345 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	ADY4	Q05955	493 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	BDF2	Q07442	638 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	YHR078W	P38799	552 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	SDS3	P40505	327 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	VHR1	P40522	640 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	MUP1	P50276	574 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	YHL017W	P38745	532 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	ALR2	P43553	858 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	PFD1	P46988	109 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	DAS1	P47005	663 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	PUS2	P53167	370 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.6	□□□□□ -1.83	not detected
YGR035C	YGR035C	CDC11	P32458	415 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	CRR1	Q05790	422 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGR035C	YGR035C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	PEX2	P32800	271 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	FMP25	Q08023	583 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	MPH2	P0CD99	609 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	YBR053C	P38235	358 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
YGR035C	YGR035C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	ASI2	P53895	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	PKH1	Q03407	766 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	UBX5	Q06682	500 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	ENV7	Q12003	364 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	HAL9	Q12180	1030 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	SUT2	Q12286	268 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	PET10	P36139	283 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	TDP1	P38319	544 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	PCL5	P38794	229 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	SAK1	P38990	1142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	PZF1	P39933	429 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	YJL163C	P46996	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	EAF1	Q06337	982 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	YOR022C	Q12204	715 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	DAL7	P21826	554 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	SSY5	P47002	699 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	AMA1	P50082	593 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	TOP3	P13099	656 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGR035C	YGR035C	YCL002C	P25565	263 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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