RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ELN	P15502	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NR1H3	Q13133	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	APBB1	O00213	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TNP2	Q05952	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	USP4	Q13107	963 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007		M0R082	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	RAC1	P63000	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	C3	P01024	1663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007		A0A1W2PNR3	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	RFC5	P40937	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	NEO1	Q92859	1461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	CPS1	P31327	1500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	SIN3B	O75182	1162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	IRAK1	P51617	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	GRIK4	Q16099	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	USP21	Q9UK80	565 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP4A	P20648	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	LILRB5	O75023	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRPL48-208	ENST00000537007	YY1	P25490	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	LRP5	O75197	1615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ADH7	P40394	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ALB	P02768	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	INHA	P05111	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	SMTN	P53814	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	GDF10	P55107	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	FZD5	Q13467	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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