RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 MCM8Q9UJA3 840 aa9.88□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 GRIN2AQ12879 1464 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A1B0GUA9 196 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 NRDCO43847 1150 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CCT5P48643 541 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SNX1Q13596 522 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 EBAG9O00559 213 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 STX6O43752 255 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 KINO60870 393 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 RWDD2BP57060 319 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CEP57Q86XR8 500 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 KCNB2Q92953 911 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CRYMQ14894 314 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 IQCA1Q86XH1 822 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 DACT1Q9NYF0 836 aa9.87□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 F13A1P00488 732 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 TRAF1Q13077 416 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SYT1P21579 422 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CDC25BP30305 580 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 GNAI1P63096 354 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CHUKO15111 745 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 HDXQ7Z353 690 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CLIC6Q96NY7 704 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 MYO1FO00160 1098 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 POTEDQ86YR6 584 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM74Q86UV6 250 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM73Q86UV7 250 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 FBXW7Q969H0 707 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 PALD1Q9ULE6 856 aa9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ROCK1Q13464 1354 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SAMD9Q5K651 1589 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 GRIK3Q13003 919 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 ENO4A6NNW6 628 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 GSDMDP57764 484 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.84□□□□□ -0.83
NHLRC3-201ENST00000379599 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 NUP155O75694 1391 aa9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 DAPK1P53355 1430 aa9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP10AO60312 1499 aa9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 GNAI3P08754 354 aa9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.83□□□□□ -0.84
NHLRC3-201ENST00000379599 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.7 ms