Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
F13A1P00488 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
F13A1P00488 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
F13A1P00488 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
F13A1P00488 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
F13A1P00488 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
F13A1P00488 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
F13A1P00488 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
F13A1P00488 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
F13A1P00488 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
F13A1P00488 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
F13A1P00488 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
F13A1P00488 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
F13A1P00488 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
F13A1P00488 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
F13A1P00488 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
F13A1P00488 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
F13A1P00488 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
F13A1P00488 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
F13A1P00488 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
F13A1P00488 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
F13A1P00488 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
F13A1P00488 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
F13A1P00488 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
F13A1P00488 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
F13A1P00488 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
F13A1P00488 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
F13A1P00488 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
F13A1P00488 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
F13A1P00488 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
F13A1P00488 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
F13A1P00488 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
F13A1P00488 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
F13A1P00488 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
F13A1P00488 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
F13A1P00488 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
F13A1P00488 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
F13A1P00488 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
F13A1P00488 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
F13A1P00488 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
F13A1P00488 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
F13A1P00488 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
F13A1P00488 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
F13A1P00488 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
F13A1P00488 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
F13A1P00488 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
F13A1P00488 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
F13A1P00488 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
F13A1P00488 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
F13A1P00488 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
F13A1P00488 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
F13A1P00488 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
F13A1P00488 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
F13A1P00488 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
F13A1P00488 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
F13A1P00488 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
F13A1P00488 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
F13A1P00488 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
F13A1P00488 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
F13A1P00488 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
F13A1P00488 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
F13A1P00488 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
F13A1P00488 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
F13A1P00488 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
F13A1P00488 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
F13A1P00488 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
F13A1P00488 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
F13A1P00488 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
F13A1P00488 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
F13A1P00488 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
F13A1P00488 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
F13A1P00488 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
F13A1P00488 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
F13A1P00488 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
F13A1P00488 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
F13A1P00488 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
F13A1P00488 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
F13A1P00488 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
F13A1P00488 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
F13A1P00488 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
F13A1P00488 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
F13A1P00488 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
F13A1P00488 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
F13A1P00488 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
F13A1P00488 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
F13A1P00488 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
F13A1P00488 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
F13A1P00488 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
F13A1P00488 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
F13A1P00488 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
F13A1P00488 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
F13A1P00488 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
F13A1P00488 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
F13A1P00488 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
F13A1P00488 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
F13A1P00488 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
F13A1P00488 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
F13A1P00488 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
F13A1P00488 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
F13A1P00488 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms