RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 SPATA32Q96LK8 384 aa7.4□□□□□ -1.22
SETX-201ENST00000224140 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.4□□□□□ -1.22
SETX-201ENST00000224140 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 CHL1O00533 1208 aa7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 DESP17661 470 aa7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 IL13P35225 146 aa7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.4□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 NECTIN2Q92692 538 aa7.4□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 MCM10Q7L590 875 aa7.39□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 TNIP1Q15025 636 aa7.39□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.39□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.39□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 ATG3Q9NT62 314 aa7.38□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.38□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 DIP2BQ9P265 1576 aa7.38□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.38□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 ST5P78524 1137 aa7.38□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.38□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.38□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.38□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 NEK1Q96PY6 1258 aa7.38□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.37□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.37□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 GBP3Q9H0R5 595 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 PDE1AP54750 535 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 ZNF790Q6PG37 636 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 CALML3P27482 149 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 ME1P48163 572 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 NLRP3Q96P20 1036 aa7.37□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 CLSTN1O94985 981 aa7.36□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 RMND1Q9NWS8 449 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 USP37Q86T82 979 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 RGS12O14924 1447 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 MAST3O60307 1309 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 IFT172Q9UG01 1749 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 SYCP1Q15431 976 aa7.36□□□□□ -1.23
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