RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	ERT1	P38140	529 aa		3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YEN1	P40028	759 aa		3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PMT3	P47190	753 aa		3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	ACE2	P21192	770 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	VBA3	P25594	458 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YNL193W	P53870	558 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	ATP25	Q03153	612 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	REH1	Q06709	432 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	ENV7	Q12003	364 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MPH2	P0CD99	609 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	GYP8	P43570	497 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YKE2	P52553	114 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MTC3	P53077	123 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YLR001C	Q07895	862 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	TRE1	Q08919	783 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	OSW2	Q12202	724 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SVS1	Q12254	260 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	PEX7	P39108	375 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	NPP2	P39997	493 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	COG8	Q04632	607 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	CDC9	P04819	755 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SRD1	P09007	221 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	CHS2	P14180	963 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	ENV11	P53246	860 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SDH1	Q00711	640 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YPR196W	Q06595	470 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MET7	Q08645	548 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MRC1	P25588	1096 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
TRZ1	YKR079C	HFM1	P51979	1187 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YLR122C	Q12312	125 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	AIM26	P32858	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MTC2	P34246	357 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	PAF1	P38351	445 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	PTC7	P38797	343 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SKN7	P38889	622 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	GTS1	P40956	396 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YGR237C	P50089	785 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YPL034W	Q03083	165 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YDR514C	Q04408	483 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SPS1	P08458	490 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RFC5	P38251	354 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	YAP1801	P38856	637 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MGS1	P40151	587 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SFB2	P53953	876 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	UME1	Q03010	460 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RSC3	Q06639	885 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RAD18	P10862	487 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	KAE1	P36132	386 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	CAF16	P43569	289 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SIZ1	Q04195	904 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	THI73	Q07904	523 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	ADP1	P25371	1049 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
TRZ1	YKR079C	VPS30	Q02948	557 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	PCL2	P25693	308 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	ICP55	P40051	511 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RSM24	Q03976	319 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RGA2	Q06407	1009 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	APL1	P27351	700 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MCD4	P36051	919 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	TY4A-J	P47023	414 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SSY1	Q03770	852 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	XYL2	Q07993	356 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	MCA1	Q08601	432 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	SFL1	P20134	766 aa		3.4	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	HOG1	P32485	435 aa		3.4	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
TRZ1	YKR079C	HSF1	P10961	833 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	PER1	P25625	357 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	ALY2	P47029	1046 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	YJR008W	P47085	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	HFD1	Q04458	532 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	GUD1	Q07729	489 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TRZ1	YKR079C	DAL7	P21826	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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