RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	KTR4	P38131	464 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	DSS1	P39112	969 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ADI1	Q03677	179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PGC1	Q08959	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MDM12	Q92328	271 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	UTR2	P32623	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YML6	P51998	286 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	AGE1	Q04412	482 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SGD1	Q06132	899 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RED1	P14291	827 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RER1	P25560	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ALR2	P43553	858 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MEP3	P53390	489 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	LAP2	Q10740	671 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SAC3	P46674	1301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	NPR3	P38742	1146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	JEM1	P40358	645 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RRN7	P40992	514 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	EAF6	P47128	113 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MRL1	Q06815	381 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RSC58	Q07979	502 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	POM152	P39685	1337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SWI5	P08153	709 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	TAF5	P38129	798 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RRF1	P38771	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MAM1	P40065	302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YIL166C	P40445	542 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	CAF120	P53836	1060 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	GTR1	Q00582	310 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	APC5	Q08683	685 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PGS1	P25578	521 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	VAC17	P25591	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	HXT10	P43581	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RET2	P43621	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	NIT2	P47016	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	NPY1	P53164	384 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	TIM50	Q02776	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	CDC45	Q08032	650 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SPO16	P17122	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RAD16	P31244	790 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MKK2	P32491	506 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SCT1	P32784	759 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	BEM3	P32873	1128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SEA4	P38164	1038 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PIC2	P40035	300 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ULP1	Q02724	621 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SSM4	P40318	1319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	MRPL33	P20084	86 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	HXT5	P38695	592 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
YKL050C	YKL050C	RSC2	Q06488	889 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	VBA3	P25594	458 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PSY4	P38193	441 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ULI1	P43604	169 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SAE2	P46946	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	ADY3	Q07732	790 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	STF1	P01098	86 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	FUN30	P31380	1131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	LYP1	P32487	611 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	UBS1	P38290	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RAD55	P38953	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	FIR1	P40020	876 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	FLP1	P03870	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	SAN1	P22470	610 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	RAD51	P25454	400 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKL050C	YKL050C	IME2	P32581	645 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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