RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 DDX58O95786 925 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
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ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa37.66■■■■□ 3.62
ECHS1-201ENST00000368547 FLAD1Q8NFF5 587 aa37.66■■■■□ 3.62
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ECHS1-201ENST00000368547 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
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ECHS1-201ENST00000368547 F6X3S4 739 aa37.6■■■■□ 3.61
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF652Q9Y2D9 606 aa37.53■■■■□ 3.6
ECHS1-201ENST00000368547 GYS1P13807 737 aa37.52■■■■□ 3.6
ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A10Q6U841 1118 aa37.52■■■■□ 3.6
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC4GQ6UXB4 293 aa37.52■■■■□ 3.6
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ECHS1-201ENST00000368547 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa37.46■■■■□ 3.59
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ECHS1-201ENST00000368547 GPTP24298 496 aa37.44■■■■□ 3.58
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ECHS1-201ENST00000368547 PANK1Q8TE04 598 aa37.44■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV5-2P06315 115 aa37.43■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A1P11836 297 aa37.43■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 C20orf194Q5TEA3 1177 aa37.43■■■■□ 3.58
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF34Q8IZ26 560 aa37.43■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 LINS1Q8NG48 757 aa37.43■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 ISCA1Q9BUE6 129 aa37.43■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
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ECHS1-201ENST00000368547 NLGN1Q8N2Q7 840 aa37.42■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 SLC16A10Q8TF71 515 aa37.42■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 PDE3AQ14432 1141 aa37.41■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa37.41■■■■□ 3.58
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ECHS1-201ENST00000368547 TMEM57Q8N5G2 664 aa37.4■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 UBN2Q6ZU65 1347 aa37.4■■■■□ 3.58
ECHS1-201ENST00000368547 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
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ECHS1-201ENST00000368547 NLRP10Q86W26 655 aa37.37■■■■□ 3.57
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ECHS1-201ENST00000368547 ALDH1L1O75891 902 aa37.36■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 TM4SF1P30408 202 aa37.36■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC191Q8NCU4 936 aa37.36■■■■□ 3.57
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