RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W ACO2P39533 789 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W MXR1P40029 184 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W SDA1P53313 767 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W CAF120P53836 1060 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W UME1Q03010 460 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W YOR223WQ12015 292 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W TMA17Q12513 150 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W SAH1P39954 449 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W DSE4P53753 1117 aa5.92□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W LCD1Q04377 747 aa5.92□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W YLR001CQ07895 862 aa5.92□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W CDC12P32468 407 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W NNK1P36003 928 aa5.91□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W SEC26P41810 973 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W NHA1Q99271 985 aa5.91□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W ERT1P38140 529 aa5.9□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W TOK1P40310 691 aa5.9□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W CDC9P04819 755 aa5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W PRO1P32264 428 aa5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SPC29P33419 253 aa5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YJL045WP47052 634 aa5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W MTC5Q03897 1148 aa5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W ACM1Q08981 209 aa5.89□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W AFR1P33304 620 aa5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W REC104P33323 182 aa5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W ENP1P38333 483 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YJR120WP47157 116 aa5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W GPG1P53130 126 aa5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W PEX8P53248 589 aa5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W HRQ1Q05549 1077 aa5.88□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SRD1P09007 221 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W RAD18P10862 487 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W NPP1P25353 742 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SLA2P33338 968 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W GPT2P36148 743 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W TYS1P36421 394 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W BAP2P38084 609 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W MGS1P40151 587 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W NIT1P40447 199 aa5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SEC6P32844 805 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YKL151CP36059 337 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W UGA2P38067 497 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W RRM3P38766 723 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W GYP8P43570 497 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W TNA1P53322 534 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SUB1P54000 292 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W TPP1Q03796 238 aa5.86□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W THS1P04801 734 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YFL054CP43549 646 aa5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W JJJ3P47138 172 aa5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W MET13P53128 600 aa5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W DAM1P53267 343 aa5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W NCE103P53615 221 aa5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W HFD1Q04458 532 aa5.85□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W PCL2P25693 308 aa5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YSC84P32793 468 aa5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W STO1P34160 861 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YEL1P34225 687 aa5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W MTC2P34246 357 aa5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W EMC3P36039 253 aa5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YKR047WYKR047W SFL1P20134 766 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GPP1P41277 250 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W NIT3P49954 291 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W RSC3Q06639 885 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W MET7Q08645 548 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W ENV7Q12003 364 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W COQ4O13525 335 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W SNF5P18480 905 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W EUG1P32474 517 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W CAF16P43569 289 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GYP7P48365 746 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W COG6P53959 839 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W ATP25Q03153 612 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YDR514CQ04408 483 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W MDM38Q08179 573 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W TRE2Q08693 809 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W SLX4Q12098 748 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YLL058WQ12198 575 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.5 ms