RNA–Protein interactions for RNA: YGR248W

SOL4, Transcript of 6-phosphogluconolactonase, yeast

Gene SOL4, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOL4	YGR248W	CYC7	P00045	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	TAF13	P11747	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	UBP12	P39538	1254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	XKS1	P42826	600 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	THI12	P42883	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	THI5	P43534	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	AVT1	P47082	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ENT3	P47160	408 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	THI11	P47183	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	CTH1	P47976	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	CTF18	P49956	741 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PEX14	P53112	341 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	DNM1	P54861	757 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	THI13	Q07748	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SWI1	P09547	1314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ATE1	P16639	503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MNR2	P35724	969 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	FET4	P40988	552 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	YGL242C	P53066	181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MLC1	P53141	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PBY1	P38254	753 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	BOL3	P39724	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PIB2	P53191	635 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ARP5	P53946	755 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	VPS64	Q03944	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SGD1	Q06132	899 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	GIC2	Q06648	383 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ERS1	P17261	260 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	RDS1	P25611	832 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	LTV1	P34078	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	TCD1	P38756	429 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SPO22	P40511	975 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	VID28	P40547	921 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	YJR008W	P47085	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	UFD2	P54860	961 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MEC3	Q02574	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SFI1	Q12369	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	GPA1	P08539	472 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	MAL33	P38157	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	CEP3	P40969	608 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	RAD26	P40352	1085 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	FYV10	P40492	516 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	RSC4	Q02206	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	CTI6	Q08923	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	RFC5	P38251	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YHL017W	P38745	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	CIN4	P39110	191 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YER130C	P39959	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	GCV1	P48015	400 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YIG1	Q08956	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	NSI1	Q12457	570 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	MMM1	P41800	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
SOL4	YGR248W	YPT11	P48559	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YKE2	P52553	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	RMT2	Q03305	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	KAR5	Q04746	504 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	GSY2	P27472	705 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	IMP2'	P32351	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	RIM11	P38615	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	BUD6	P41697	788 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	CIT3	P43635	486 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SOL4	YGR248W	ATG1	P53104	897 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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