RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W PCD1Q12524 340 aa10.21□□□□□ -0.77
CPD1YGR247W FAB1P34756 2278 aa10.21□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W PPZ1P26570 692 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W COQ8P27697 501 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W YHL026CP38740 315 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W YAP1801P38856 637 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W SPO22P40511 975 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W PCI8P40512 444 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W YGL138CP53122 345 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W GIS4Q04233 774 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W SMC5Q08204 1093 aa10.2□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W ILV1P00927 576 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W DED1P06634 604 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W WHI2P12611 486 aa10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W BMH2P34730 273 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W UBX7P38349 436 aa10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W APM2P38700 605 aa10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W EAF5P39995 279 aa10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W YJL045WP47052 634 aa10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W MFM1Q02783 413 aa10.19□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W CLN3P13365 580 aa10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W ADE2P21264 571 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W GAA1P39012 614 aa10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W FIS1P40515 155 aa10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W HXT17P53631 564 aa10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W FAP1P53971 965 aa10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W COQ9Q05779 260 aa10.18□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W KEX2P13134 814 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W FBP26P32604 452 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W OPY1P38271 328 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W ORC6P38826 435 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W CIT3P43635 486 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W DIP5P53388 608 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W RET3P53600 189 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W DSE4P53753 1117 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W GCR2Q01722 534 aa10.17□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W YLR422WQ06409 1932 aa10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W SUP45P12385 437 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W SEC21P32074 935 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W YHR202WP38887 602 aa10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W CCC2P38995 1004 aa10.16□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W VID28P40547 921 aa10.15□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W ROD1Q02805 837 aa10.15□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W IRC10Q08118 586 aa10.15□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W NCR1Q12200 1170 aa10.15□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W RLF2Q12495 606 aa10.15□□□□□ -0.78
CPD1YGR247W HCA4P20448 770 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W HXT13P39924 564 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W MOB1P40484 314 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W BRE2P43132 505 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W LAM5P43560 674 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W EPL1P43572 832 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W SGO1Q08490 590 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W MNL2Q12205 849 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W CEX1Q12453 761 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W TOR1P35169 2470 aa10.14□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W SNF1P06782 633 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W BET2P20133 325 aa10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W GSY1P23337 708 aa10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W TMT1P32643 299 aa10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W CSE2P33308 149 aa10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W SAF1P38352 637 aa10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W AIM9P40053 627 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W FYV10P40492 516 aa10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W NAF1P53919 492 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data10.13□□□□□ -0.79not detected
CPD1YGR247W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W LEO1P38439 464 aa10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W YIR016WP40572 265 aa10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W KRI1P42846 591 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W SPP1Q03012 353 aa10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W SRD1P09007 221 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W MATALPHA2P0CY08 210 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W HMLALPHA2P0CY09 210 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W THR4P16120 514 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W BIO2P32451 375 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W CCL1P37366 393 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W PEX28P38848 579 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W RPN10P38886 268 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W YKE2P52553 114 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W TPO2P53283 614 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W ARP5P53946 755 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W YOR022CQ12204 715 aa10.11□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W APE1P14904 514 aa10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W ATG19P35193 415 aa10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W XDJ1P39102 459 aa10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W ATG32P40458 529 aa10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W YGL081WP53156 320 aa10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W RRD2Q12461 358 aa10.1□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W TCP1P12612 559 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W GLN3P18494 730 aa10.09□□□□□ -0.79
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