RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	VAC14	Q06708	880 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YPD1	Q07688	167 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TCB1	Q12466	1186 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MMS1	Q06211	1407 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YRO2	P38079	344 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	POP4	P38336	279 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MPS2	P53159	387 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YGR021W	P53212	290 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RAD3	P06839	778 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PIF1	P07271	859 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TBS1	P38114	1094 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ATG3	P40344	310 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	DSE4	P53753	1117 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SCS7	Q03529	384 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	COX13	P32799	129 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YKL100C	P34248	587 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MND1	P53102	219 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	DID2	P69771	204 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SSP2	Q08646	371 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EMP46	Q12396	444 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ATP7	P30902	174 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	DBF4	P32325	704 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PRM2	P40534	656 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	IAH1	P41734	238 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ULP1	Q02724	621 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	REC107	P21651	314 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YLF2	P38746	405 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	IRC5	P43610	853 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YGL176C	P46945	554 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YML6	P51998	286 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ALT2	P52892	507 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FOL1	P53848	824 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VPS74	Q06385	345 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MLC2	Q06580	163 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YLL058W	Q12198	575 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PET111	P08468	800 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VID30	P53076	958 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CHS2	P14180	963 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ITT1	Q04638	464 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VPS5	Q92331	675 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SPS1	P08458	490 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	INO1	P11986	533 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	NGG1	P32494	702 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SEC6	P32844	805 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	OPY1	P38271	328 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HDA2	Q06629	674 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SGT1	Q08446	395 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YDR056C	Q12025	205 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ELG1	Q12050	791 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PES4	P39684	611 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PMS1	P14242	873 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	REB1	P21538	810 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YIH1	P25637	258 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HEL1	P36113	551 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TFA2	P36145	328 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PZF1	P39933	429 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EPS1	P40557	701 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.91	□□□□□ -1.94	not detected
TOM1	YDR457W	MFM1	Q02783	413 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YKU80	Q04437	629 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GAD1	Q04792	585 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ULA1	Q12059	462 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CYM1	P32898	989 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YRB2	P40517	327 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CWH41	P53008	833 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SSN2	P38931	1420 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RSR1	P13856	272 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms