RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 PLIN1O60240 522 aa29.18■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PDIA6Q15084 440 aa29.18■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNRD1Q16881 649 aa29.18■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 G2E3Q7L622 706 aa29.18■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NBPF26B4DH59 902 aa29.17■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 STARD3NLO95772 234 aa29.17■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NBPF14Q5TI25 921 aa29.17■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NBPF15Q8N660 670 aa29.17■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM5Q71RC9 77 aa29.17■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PLSCR1O15162 318 aa29.16■■■□□ 2.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 STK31Q9BXU1 1019 aa29.16■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.15■■■□□ 2.26
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.15■■■□□ 2.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF428Q96B54 188 aa29.13■■■□□ 2.25
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TSNARE1-208ENST00000524325 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
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TSNARE1-208ENST00000524325 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.1■■■□□ 2.25
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.1■■■□□ 2.25
TSNARE1-208ENST00000524325 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.1■■■□□ 2.25
TSNARE1-208ENST00000524325 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
TSNARE1-208ENST00000524325 BAG6P46379 1132 aa29.08■■■□□ 2.25
TSNARE1-208ENST00000524325 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.08■■■□□ 2.25
TSNARE1-208ENST00000524325 FLIIQ13045 1269 aa29.07■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.07■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ARXQ96QS3 562 aa29.07■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 LY75O60449 1722 aa29.07■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 COPS6Q7L5N1 327 aa29.06■■■□□ 2.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 HYPKQ9NX55 129 aa29.05■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.04■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.04■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.04■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 F6X3S4 739 aa29.03■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.02■■■□□ 2.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF827Q17R98 1081 aa29.02■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC125Q86Z20 511 aa29.02■■■□□ 2.24
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF14O94880 888 aa29.01■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 KIF16BQ96L93 1317 aa29■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 RLBP1P12271 317 aa28.99■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 PANK1Q8TE04 598 aa28.99■■■□□ 2.23
TSNARE1-208ENST00000524325 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.98■■■□□ 2.23
TSNARE1-208ENST00000524325 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.98■■■□□ 2.23
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.98■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.96■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.95■■■□□ 2.23
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TSNARE1-208ENST00000524325 ADCY9O60503 1353 aa28.94■■■□□ 2.22
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TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.94■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.94■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.93■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 COL15A1P39059 1388 aa28.93■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.92■■■□□ 2.22
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