RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 HYPKQ9NX55 129 aa17.27■□□□□ 0.36
ZBED1-203ENST00000381223 FLT4P35916 1363 aa17.27■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 HOXC9P31274 260 aa17.27■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ATP8B2P98198 1209 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 STK38Q15208 465 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 SPATA32Q96LK8 384 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 MPHOSPH8Q99549 860 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 MSH6P52701 1360 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 TNMDQ9H2S6 317 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 GCP02774 474 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ADAMTS2O95450 1211 aa17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 HOMER1Q86YM7 354 aa17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.25■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 GOLIM4O00461 696 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CPA1P15085 419 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CCT2P78371 535 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CHL1O00533 1208 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD1Q15327 319 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 METTL24Q5JXM2 366 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC82Q8N4S0 544 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 PIP4K2BP78356 416 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.24■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ABCF2Q9UG63 623 aa17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 HAND2P61296 217 aa17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 HSPA2P54652 639 aa17.22■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 PIBF1Q8WXW3 757 aa17.22■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17.22■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 KLHDC4Q8TBB5 520 aa17.22■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC192P0DO97 292 aa17.22■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 ZFYVE9O95405 1425 aa17.21■□□□□ 0.35
ZBED1-203ENST00000381223 GJB2P29033 226 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 METP08581 1390 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 GRM8O00222 908 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 SMC2O95347 1197 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 USP25Q9UHP3 1055 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 EVI5LQ96CN4 794 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 USP26Q9BXU7 913 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 LMBR1LQ6UX01 489 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 STARD3NLO95772 234 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 KSR2Q6VAB6 950 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 PDILTQ8N807 584 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 STX6O43752 255 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 NBPF4Q96M43 638 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 TBX22Q9Y458 520 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 KCNQ3O43525 872 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 PDE4CQ08493 712 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 USP19O94966 1318 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 KRT32Q14532 448 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 SNX21Q969T3 373 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 LRP2BPQ9P2M1 347 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 TDO2P48775 406 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 CHMLP26374 656 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 MAP3K5Q99683 1374 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 KLHL40Q2TBA0 621 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 RAI14Q9P0K7 980 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-203ENST00000381223 AIDAQ96BJ3 306 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms